python和用户定义的函数

Question

我正在学习python编码，并使用一个函数来计算具有不确定字符N或n的DNA序列中的gc百分比（NAAATTTGGGCCCN），这产生了以下问题。有没有办法克服这个问题？

def gc(sequence) :
    "This function computes the GC percentage of a dna sequence"
    nbases=sequence.count('n')+sequence.count('N')
    gc_count=sequence.count('c')+sequence.count('C')+sequence.count('g')+sequence.count('G')      #total gc count
    gc_percent=float(gc_count)/(len(sequence-nbases))     # TOTAL GC COUNT DIVIDED BY TOTAL LEN OF THE sequence-TOTAL NO. OF N
    return 100 * gc_percent

Answer 1

正如@jasonharper在评论中所说，您需要关闭Len（）函数。因此将len（sequence-nbases）更改为len（sequence）-nbases。干杯。

len（sequence）-nbases