未经root权限加载R软件包：libproj.so.0：无法打开共享对象文件

Question

我在没有root许可的SLURM服务器中工作，并且我试图加载一些R软件包（'sp'）进行一些分析。

但是，当我加载软件包时，出现以下错误：

Loading required package: sp
Error: package or namespace load failed for ‘sp’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '/tools/R/R-3.6.1/lib64/R/library/sp/libs/sp.so':
  libproj.so.0: cannot open shared object file: No such file or directory

我检查了libproj.so.0的位置，得到了以下结果：

/usr/lib64/libproj.so.0
/usr/lib64/libproj.so.0.7.0

我的猜测是，通过检查stackoverflow上的类似问题，我应该在/usr/lib64/libproj.so.0和/usr/local/lib之间创建符号链接。但是，我没有root权限才能成功执行此操作。

关于如何解决问题的任何建议？

Answer 1

我遇到与您类似的问题，但是在尝试执行library(vcfR)时找不到libRlapack.so我收到此错误：

Error: package or namespace load failed for ‘vcfR’ in dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...):
 unable to load shared object '~/bin/miniconda3/envs/r/lib/R/library/Matrix/libs/Matrix.so':
  libRlapack.so: cannot open shared object file: No such file or directory

我使用vcfR将conda install -c r r-vcfr下载到了R environment中>

[就像我一样，我没有sudo权限，因此无法使用其他人建议的方法（例如，使用符号链接等）。

您解决问题了吗？