更改 R CMD INSTALL 中的 CXXFLAGS 以开发 R 包

Question

我正在尝试调试我正在开发的包。 我使用 makefile 来构建、检查和安装软件包。 这些软件包是一个 Rcpp 软件包，因此其中已经有一个 makevars 和 makevars.win 文件。 我正在寻找的是仅针对特定的 make 规则更改 CXXFLAGS 。 然后

make debug

将与

R CMD INSTALL

一起运行

CXXFLAGS= -Wall -pedantic -g -O0"

，但常规

make install

将与

CXXFLAGS=-O3

一起运行，没有任何调试信息。 有没有一种好方法可以动态更改此设置，而无需修改我的包、个人或系统 makevars 文件？

Answer 1

我不这么认为，因为只有一个

CXXFLAGS

可以走动。 但是您可以在不同的“make”与“make debug”目标部分中再次重新分配。

您可以只保留两个版本

~/.R/Makevars.normal

amd

~/R/Makevars.debug

并使用脚本来翻转它们之间的链接...

物有所值。我只是编辑

~/.R/Makevars

并注释/取消注释不同的行。

编辑：基于您发布的

Makefile

，这样的事情怎么样：

install: $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz
    CXXFLAGS+="-O3" R CMD INSTALL $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz

debuginstall: $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz
    CXXFLAGS+="-Wall -g -O0" R CMD INSTALL $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz

编辑2：我刚刚玩过这个，它有效：

PKG_NAME=digest
PKG_VERSION=0.5.1

install: $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz
    PKG_CFLAGS="-O6" R CMD INSTALL $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz

debuginstall: $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz
    PKG_CFLAGS="-Wall -g -O0" R CMD INSTALL $(PKG_NAME)_$(PKG_VERSION).tar.gz

它still随后读取我的

~/.R/Makevars

，因此无法在此处设置某些变量。 但是您可以在

MYDEBUG=...

中设置

Makefile

，然后在

~/.R/Makevars

中的定义中使用它。

Answer 2

包的

-O

文件中的任何

Makevars

标志都将被 R 的

-O2

文件中的

Makeconf

覆盖，因为 GCC 只会尊重编译命令中的最后一个

-O

标志。如果软件包分发到其他平台，Dirk 设置

~/.R/Makevars

文件的答案将不起作用，除非您可以告诉每个使用您的软件包的人创建或修改他们的

~/.R/Makevars

。

因为

-O3

是

-O2

+ 一些其他标志，所以你可以将你的包的

Makevars

写成如下：

PKG_CXXFLAGS += -fgcse-after-reload \
-fipa-cp-clone \
-floop-interchange \
-floop-unroll-and-jam \
-fpeel-loops \
-fpredictive-commoning \
-fsplit-loops \
-fsplit-paths \
-ftree-loop-distribution \
-ftree-partial-pre \
-funswitch-loops \
-fvect-cost-model=dynamic \
-fversion-loops-for-strides

即使背面有 -O2，这些标志（请参阅 GCC 手册

https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Optimize-Options.html

）也会受到尊重。

根据我多年来在不同平台上的科学计算中使用这些标志的经验，由于积极的优化产生了更大的二进制文件，

-O3

几乎从未优于

-O2

。然而，以下几乎总是生成最快的代码：

PKG_CXXFLAGS += -march=native -ffast-math

请注意，

-ffast-math

（https://gcc.gnu.org/onlinedocs/gcc/Optimize-Options.html#index-ffast-math）应谨慎使用。