如何使用sed分割字符串？

Question

我是bash脚本的新手。我想分割以下字符串，

chr14:81370042-81371098(+)

进入

chr14 81370042 81371098 +

或

chr14:81370042-81371098(-)

进入

chr14 81370042 81371098 -

[请告诉我如何使用在两种情况下都可以使用的命令来做到这一点。

我尝试过，cat a.tsv | tr -s ':' '\t' | sed "s/\t[0-9]+.*[0-9]+/[0-9]+\t[0-9]/g"，它不起作用。

谢谢。

Answer 1

此sed可能起作用：

sed -E 's/[^-+_[:alnum:]]+/ /g; s/ +$//; s/-(.)/ \1/g' <<< 'chr14:81370042-81371098(+)'

chr14 81370042 81371098 +

否则：

sed -E 's/[^-+_[:alnum:]]+/ /g; s/ +$//; s/-(.)/ \1/g' <<< 'chr14:81370042-81371098(-)'

chr14 81370042 81371098 -

[[^-+_[:alnum:]]+匹配1个或多个不是-，+，_和字母数字的字符。

Answer 2

$ sed 's/[():]/ /g; s/-/ /' file
chr14 81370042 81371098 +
chr14 81370042 81371098 -

或者如果您不喜欢留下的结尾空白字符，则：

$ sed 's/[(:]/ /g; s/)//; s/-/ /' file
chr14 81370042 81371098 +
chr14 81370042 81371098 -

Answer 3

使用显示的示例进行了书面和测试，请尝试以下。

echo "chr14:81370042-81371098(+)" | awk '{gsub(/:|-|\(|\)/,OFS)} 1'

[第二解决方案：在awk中使用字段分隔符。

echo "chr14:81370042-81371098(+)"  | 
awk -v FS=':|-|\(|\)' '{
  $1=$1
  sub(/ +$/,"")
}
1'