我试图将一些excel文件读入数据帧,然后写入MySQL数据库。以下程序能够读取文件并创建数据帧但是当它尝试使用dbWriteTable
命令写入数据库时,我收到一条错误消息 -
Error in .local(conn, statement, ...) :
could not run statement: The used command is not allowed with this MySQL version
library(readxl)
library(RMySQL)
library(DBI)
mydb = dbConnect(RMySQL::MySQL(), host='<ip>', user='username', password='password', dbname="db",port=3306)
setwd("<directory path>")
file.list <- list.files(pattern='*.xlsx')
print(file.list)
dat = lapply(file.list, function(i){
print(i);
x = read_xlsx(i,sheet=NULL, range=cell_cols("A:D"), col_names=TRUE, skip=1, trim_ws=TRUE, guess_max=1000)
x$file=i
x
})
df = do.call("rbind.data.frame", dat)
dbWriteTable(mydb, name="table_name", value=df, append=TRUE )
dbDisconnect(mydb)
我检查了dbWriteTable
函数的定义,看起来它正在使用load data local inpath
将数据存储在数据库中。根据Stackoverflow上的一些其他回答问题,我理解local
这个词可能引起关注,但由于它已经在函数定义中,我不知道我能做什么。此外,此语句使用“,”作为分隔符。但是我的数据在某些值中有“,”这就是为什么我对使用数据帧感兴趣,希望它能保留源结构。但现在我不太确定。有没有其他方法/函数将数据帧写入MySQL表?
我通过在服务器上的my.cnf文件中添加以下行来解决这个问题(您可能需要使用root和vi进行编辑!)。在我的这个位于'[mysqld]'线下面
local-infile=1
然后重启服务器。祝好运!
您可能需要将dbWriteTable(mydb, name="table_name", value=df, append=TRUE )
更改为
dbWriteTable(mydb, name="table_name", value=df,field.types = c(artist="varchar(50)", song.title="varchar(50)"), row.names=FALSE, append=TRUE)
这样,您可以在R中指定字段类型并将数据附加到MySQL表中。