knitr在Stan chunk上失败，缓存= TRUE

Question

根据this Github issue（针对knitr v1.12标记为固定），应该可以在编织器中缓存Stan块，以便每次编织文件时都不需要重新编译Stan模型对象。

但是，使用knitr v1.20（Rt3.5.1在RStudio v1.1.463中），当第二次编织文件时（以便已经构建了缓存），我收到一个错误：

Quitting from lines 9-18 (Testing_Stan_cache.Rmd) 
Error in fun(environment()) : invalid first argument
Calls: <Anonymous> ... call_block -> <Anonymous> -> lazyLoad -> lazyLoadDBexec -> fun
Execution halted

示例Rmarkdown文件（错误中提到的第9-18行是Stan块）：

---
title: "Testing Stan cache"
output: html_document
---

## Stan model

```{stan output.var="ex1", cache=TRUE}
data {
  int<lower=0, upper=1> X[100];
}
parameters {
  real<lower=0, upper=1> p;
}
model {
  X ~ bernoulli(p);
}
```

## Run the model 

```{r}
library(rstan)
fit <- sampling(ex1, data=list(X = rbinom(100, 1, 0.3)))
print(fit)
```

我也在Stan chunk选项中尝试使用cache.lazy=FALSE，但得到了一个不同的错误：

Quitting from lines 23-26 (Testing_Stan_cache.Rmd) 
Error in sampling(ex1, data = list(X = rbinom(100, 1, 0.3))) : 
  object 'ex1' not found
Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible -> eval -> eval -> sampling
Execution halted

Answer 1

这是knitr的一个错误，I just fixed on Github。请尝试当前的开发版本：

remotes::install_github('yihui/knitr')