我有一个文本文件，我想删除其中的特定模式

Question

我尝试使用 AWK 和 SED 命令在 BASH 中进行编码，但没有获得所需的输出，请帮助我使用简单的代码来解决我的问题。看我有一个包含这样内容的文本文件。

>AC201869.46386.47908 Regiella insecticola
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCGGGGAGTAGCTTGCTACTCTGCCGGCGAGCGGC
>JQ765428.1.1430 Pantoea dispersa
GCAGCTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACAGAAGAGCTTGCTCTTTGGGTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCCGATGGA

我需要如下输出。

>Regiella insecticola
AGAGTTTGATCATGGCTCAGATTGAACGCTGGCGGCAGGCCTAACACATGCAAGTCGAGCGGCAGCGGGGAGTAGCTTGCTACTCTGCCGGCGAGCGGC
>Pantoea dispersa
GCAGCTACACATGCAAGTCGAACGGCAGCACAGAAGAGCTTGCTCTTTGGGTGGCGAGTGGCGGACGGGTGAGTAATGTCTGGGAAACTGCCCGATGGA

我尝试了这样的命令和其他命令，但它们不起作用

sed 's/[1-9]/./g' silva_species_assignment_v132.fa -> textfile.txt 

Answer 1

以下简单的

sed

脚本将删除

>

和第一个空格之间的所有内容。

sed 's/^>[^ ]* />/' file.fasta >newfile.fasta