SAM(序列比对/图)格式比对标签

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我正在使用samtools删除重复项。标记然后删除重复的标记取决于ms(队友得分)和固定队友提供的MC(队友雪茄)标签。

有人知道这些标签到底是什么吗?固定对象的表现如何?

感谢您的帮助!

duplicates tags sequence-alignment samtools
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MC标签是Mate CIGAR的伴侣,而白色是其伴侣的CIGAR。 ms不是标准标记,但我认为它是其配对的分数。

您可以在规格中找到详细信息:https://samtools.github.io/hts-specs/SAMtags.pdf

[fixmates应该只是将数据从一个配合复制到另一配合,反之亦然。

BTW,这不是编程问题,因此不是询问此问题的适当位置。更好地尝试生物信息学。

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