我正在使用samtools删除重复项。标记然后删除重复的标记取决于ms(队友得分)和固定队友提供的MC(队友雪茄)标签。
有人知道这些标签到底是什么吗?固定对象的表现如何?
感谢您的帮助!
MC
标签是Mate CIGAR的伴侣,而白色是其伴侣的CIGAR。 ms
不是标准标记,但我认为它是其配对的分数。
您可以在规格中找到详细信息:https://samtools.github.io/hts-specs/SAMtags.pdf
[fixmates
应该只是将数据从一个配合复制到另一配合,反之亦然。
BTW,这不是编程问题,因此不是询问此问题的适当位置。更好地尝试生物信息学。