问题概要
很抱歉问了一个简单的问题,但我是R的新手,在执行地图任务时遇到了困难。
我收集了一批十进制形式的经度和纬度GPS点,这些点是在实地收集的。我的目的是将这些GPS点绘制到我从GADM资源中提取的斯里兰卡地图上。
运行代码后,斯里兰卡的南端从经纬度网格框的中上部突出,而不是在经纬度网格框内可以看到斯里兰卡的整个图像(见图2)。
问题。
我可以单独制作斯里兰卡地图(见图2),也可以单独制作经纬度网格框(见图1)。然而,我在绘制经纬度网格框内的斯里兰卡地图时遇到了问题,同时也无法将网格框内的GPS点绘制在实地采集数据的正确位置。
所需的输出结果见图3(见下图)。我试图将图像1放置在网格框内,并将斯里兰卡的正确经纬度刻度放在网格框的边缘。最后,我想在地图上绘制GPS点,就像图3中提供的例子一样。
如果有人能够帮助我,我将非常感激。
由于我的知识不足,我真的搞不清楚这里到底出了什么问题,在尝试了许多小时的不同R代码组合后,为了解决这个问题,我试图重现这个问题 堆栈溢出问题 并通过以下方式 物种分布建模练习.
非常好的问候。
R码
##Libraries that are going to be used:
library("sp")
library("raster")
library("maptools")
library("rgdal")
library("dismo")
library("spatialEco")
library("ggplot2")
library("dplyr")
###Open the directory pathway
Blue.whale<-readr::read_csv("Blue_Whale_GPS_Best.csv")
summary(Blue.whale)
##Plotting the map of Sri Lanka
bioclim1.data <- getData('GADM', country='LKA', level=1)
Sri_Lanka<-plot(bioclim1.data, main="Adm. Boundaries Sri Lanka Level 0")
###My attempt at creating a longitude/latitude grid box
Sri.Lanka.bbox<-bbox(Blue.whale)
xlim <- c(min(Sri.Lanka.bbox[1,1]), max(Sri.Lanka.bbox[1,2]))
ylim <- c(min(Sri.Lanka.bbox[2,1]), max(Sri.Lanka.bbox[2,2]))
###Plot the longitude/latitude grid box
dev.new()
plot(Sri_Lanka, xlim=xlim, ylim=ylim, add=T)
##Plot map
par(mfrow=c(1,1))
dev.new()
####Convert the format of the data from factors to numeric
Latitude<-as.numeric(Blue.whale$Latitude)
Longitude<-as.numeric(Blue.whale$Longitude)
##To make species distribution modeling more streamlined, it is useful to have an
##idea of how widely our species is geographically distributed. We are going to find
##general latitudinal and longitudinal boundaries and store this information:
# Determine geographic extent of our data
max.lat <- ceiling(max(Blue.whale$Latitude))
min.lat <- floor(min(Blue.whale$Latitude))
max.lon <- ceiling(max(Blue.whale$Longitude))
min.lon <- floor(min(Blue.whale$Longitude))
geographic.extent <- extent(x = c(min.lon, max.lon, min.lat, max.lat))
# Plot the base map
dev.new()
plot(bioclim1.data,
xlim = c(min.lon, max.lon),
ylim = c(min.lat, max.lat),
axes = TRUE,
col = "grey95")
# Add the points for individual observation
points(x = Blue.whale$Longitude,
y = Blue.whale$Latitude,
col = "olivedrab",
pch = 15,
cex = 0.50)
图片一:图片二:图片三:图片四:图片五:图片六
图片二:
图片3:
例3,他们已经裁剪了美国的地图,以集中在该物种发生的地方,而你想显示鲸鱼目击事件发生的地方与整个斯里兰卡国家的关系。为了同时显示整个国家和所有的目击事件,你需要改变你的绘图限制,以匹配两个数据源的极端。这段代码应该可以生成你所需要的图,你可以在其中添加 ceiling
floor
论点,必要时改善美学。
##get bounding box of Sri Lanka shapefile
bb=bioclim1.data@bbox
plot(bioclim1.data,
xlim = c(min(c(min.lon,bb[1,1])), max(c(max.lon,bb[1,2]))),
ylim = c(min(c(min.lat,bb[2,1])), max(c(max.lat,bb[2,2]))),
axes = TRUE,
col = "grey95")
# Add the points for individual observation
points(x = Blue.whale$Longitude,
y = Blue.whale$Latitude,
col = "olivedrab",
pch = 15,
cex = 0.50)