如何安装solaris（在colab上或本地）？

Question

我连续几天尝试在本地、google colab 或 renkulab (https://renkulab.io/) 上安装Solaris (https://github.com/CosmiQ/solaris)。到目前为止，没有任何运气。我在所有平台上尝试了不同的方法：

1. 创建 conda 环境（按作者推荐）
2. 直接通过pip
3. 还可以克隆存储库并直接访问文件夹和功能

到目前为止，所有这些方法都失败了。大多数情况下，GDAL 存在轮子构建错误。我已经先安装了。我没有找到任何适当的文档或其他失败描述，这让我质疑自己......也许这里有人有这个库的经验？

我非常感谢每一个提示。

非常感谢

Answer 1

Colab 设置

我可以通过以下方式在 Colab 中进行设置：

第一个单元：安装 Mamba/Conda

!pip install -q condacolab
import condacolab
condacolab.install()

这将触发运行时重新启动 - 它是故意这样做的。

第二个单元：安装 Solaris 必备组件

我假设我们想要支持 GPU 的版本。如果没有，

solaris

存储库中还有另一个用于仅 CPU 环境的 YAML。

!wget https://raw.githubusercontent.com/CosmiQ/solaris/main/environment-gpu.yml
!mamba env update -n base -f environment-gpu.yml

完成后手动重新启动运行时！

第三个单元：安装 Solaris

!pip install solaris

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应该是这样。按照这些步骤，我可以导入模块并使用入口点，例如，

模块导入 ✅

import solaris

入口点示例 ✅

!make_masks -h

NumPy 未来对 TensorFlow 代码中的某些语法发出了一些弃用警告，但除此之外，似乎还可以使用。不过我个人并没有使用这个工具，所以不知道是否还有更多可以验证的地方。

Answer 2

现在最简单的方法是在容器中使用 docker 和预安装的 Solaris - 这里链接到 cosmiqwork 准备的一个。运行容器后，您可以在容器上运行代码。