如何使用python中的networkx在有向（非对称）图中制作两条边（从一个节点开始的1条边和以该节点结束的2nd边）bw两个节点？

Question

我有 50 个城市的距离矩阵。 前 10 个城市的样本矩阵如下所示：

	0	1	2	3	4	5	6	7	8	9
0	0	信息	1033.836	2954.445	信息	570.7902	信息	5201.642	927.6648	信息
1	信息	0	846.4284	2988.993	1739.0	586.6539	556.8027	4718.087	992.3883	信息
2	1065.751	信息	0	3713.848	2328.803	1293.154	922.5469	5968.72	1660.567	917.3977
3	3093.118	2721.323	3738.992	0	1386.044	2593.299	2926.249	2167.597	2188.789	2756.88
4	1547.838	1609.13	2530.782	1509.116	0	1071.186	信息	3437.752	624.6915	1348.369
5	541.9545	603.5713	1270.946	2354.782	1026.145	0	204.1122	4501.91	436.0267	401.6861
6	459.8273	581.1262	1058.695	2634.319	1264.167	信息	0	信息	717.3868	300.6823
7	4815.335	5330.784	5322.427	2153.888	3612.119	4600.471	5372.185	0	3998.066	5173.963
8	789.3162	901.9897	1795.072	2139.049	635.1849	434.8522	738.8418	4598.177	0	775.1959
9	794.9219	244.2613	信息	2964.827	1463.854	388.5041	297.126	5215.893	845.9431	0

矩阵中城市不相连的地方有“inf”，对角线有0。我想可视化从（比如说）城市 3 到城市 4 以及从城市 4 到城市 3 的路径。

我想在Python中使用networkx可视化这个矩阵。我没有得到预期的正确输出。根据这个问题：（如何在Python中使用networkx绘制有向图？）以及raz给出的答案，我能够通过“有向和箭头”可视化获得以下图表， 使用以下代码可视化非对称距离矩阵：

G = nx.DiGraph(directed=True)

num_nodes = 10 #considering only first 10 cities

for i in range(num_nodes):
    for j in range(num_nodes): 
        if (distance_matrix[i][j] != 0) and (distance_matrix[i][j] != np.inf):
            G.add_edge(i, j, weight=distance_matrix[i][j])


pos = nx.random_layout(G, seed=6)
edge_labels = {key: round(value, 3) for key, value in nx.get_edge_attributes(G, "weight").items()} #Doing this just to control the prescision of the distances

options = {
    'node_color': 'lightblue',
    'node_size': 100,
    'width': 1,
    'arrowstyle': '-|>',
    'arrowsize': 12,
}

plt.figure(figsize=(10, 10))
nx.draw_networkx(G, pos, arrows=True, **options)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, edge_labels=edge_labels, font_size=5)
plt.title("Distance Matrix Visualized as Graph")
plt.show()

我得到了这个可视化非对称距离矩阵的可视化。

此处仅显示一侧边缘。我希望显示两侧边缘（显然具有不同的值）。

例如：从城市 3 到城市 4 的边距离为 1386.0443，从城市 4 到城市 3 的边距离为 1509.1162。但该图只绘制了 1509.1162

以下代码

print(G[4][3]['weight'])
print(G[3][4]['weight'])

产量：

1509.11627820888
1386.044382692059

即，该图具有有关两个方向的边缘的信息，但它仍然只显示一侧的边缘。

我需要帮助来正确绘制有向非对称图中任意两个城市之间的两条边（即，一条边从一个城市开始，另一条边以该城市结束）。

Answer 1

您可以在

'connectionstyle': 'arc3,rad=-0.1'

和

draw_networkx

中为边缘添加一些曲率（例如使用选项

draw_networkx_edge_labels

）：

options = {
    'node_color': 'lightblue',
    'node_size': 100,
    'width': 1,
    'arrowstyle': '-|>',
    'arrowsize': 12,
    'connectionstyle': 'arc3,rad=-0.1',
}

nx.draw_networkx(G, pos, arrows=True, **options)
nx.draw_networkx_edge_labels(G, pos, connectionstyle=options['connectionstyle'],
                             edge_labels=edge_labels, font_size=5)

输出：