在R包中使用C++执行头

Question

我正在开发一个包含C++代码的R包，我想使用标准库头“执行”。由于 C++17 现在是 CRAN 上的默认值，这似乎没问题。然而，这个头文件尚未在 Apple Clang 中实现，并且从 R for macOS Developer 网站可以看出，macOS 上的 R 包中的 C++ 代码将使用 Apple 的工具链进行编译。

因此，我的问题是：假设我有一个类似于下面的函数，并行计算集合差。这会导致 CRAN 上的 macOS 包构建失败吗？

#include <RcppArmadillo.h>
#include <execution>
using namespace arma;

// [[Rcpp::export]]
vec setdiff(const vec& x, const vec& y) {
  vec xs = sort(x);
  vec ys = sort(y);

  std::vector<double> diff;
  std::set_difference(
    std::execution::par,
    xs.begin(), xs.end(), ys.begin(), ys.end(),
    std::inserter(diff, diff.begin()));

  return conv_to<vec>::from(diff);
}

/*** R
setdiff(1:10, 3)
*/

在我自己的 M1 Mac 上，我可以通过将以下行添加到

~/.R/Makevars

来进行编译，从而确保我使用 g++ 而不是 Apply clang。

CXX=/opt/homebrew/bin/g++-13
CXX17=/opt/homebrew/bin/g++-13

Answer 1

我尝试了类似于@SymbolixAU 在评论中建议的内容。

我创建了一个名为

anRpackage

的包，其中包含以下文件：

• DESCRIPTION

Package: anRpackage
Type: Package
Title: What the package does (short line)
Version: 1.0
Date: 2024-01-09
Author: Who wrote it
Maintainer: Who to complain to <[email protected]>
Description: More about what it does (maybe more than one line). One more 
  sentence.
License: GPL-3
Imports: Rcpp
LinkingTo: Rcpp, RcppArmadillo
RoxygenNote: 7.2.3
Encoding: UTF-8

• src/setdiff.cpp

#include "RcppArmadillo.h"
#include <execution>
using namespace arma;

// [[Rcpp::depends(RcppArmadillo)]]


// [[Rcpp::export]]
arma::vec setdiff_par(const arma::vec& x, const arma::vec& y) {
  vec xs = sort(x);
  vec ys = sort(y);
  
  std::vector<double> diff;
  std::set_difference(
    std::execution::par,
    xs.begin(), xs.end(), ys.begin(), ys.end(),
    std::inserter(diff, diff.begin()));
  
  return conv_to<vec>::from(diff);
}

• src/Makevars

  和

  src/Makevars.win

PKG_CXXFLAGS = $(SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS)
PKG_LIBS = $(SHLIB_OPENMP_CXXFLAGS) $(LAPACK_LIBS) $(BLAS_LIBS) $(FLIBS)

• 包含自动生成的

  R

  的

  RcppExports.R

  目录。

提交给win-builder，

devtools::check_win_devel()

，成功了。相反，提交到 R Mac Builder，构建失败了。

Answer 2

您遇到了问题特定的编译器和 C++17 的实现，这与 C++17“本身”的问题不同。

编写 R 扩展 IIRC 非常清楚“由编译器提供”。在这种情况下，您想要的 C++17 功能由最新的

g++

版本（包括 macOS）提供，但 不是 （由 CRAN macOS 维护者规定）

clang++

版本您在 macOS 上遇到。

在工具链更新之前，您无法在 macOS 的 CRAN 上使用此功能。