我想在本地运行ChromHMM工具，该工具在完成计算后将打开Web浏览器。该工具使用
java.awt.Desktop.getDesktop().browse((new File(...)).toURI())
并且它没有防止这种行为的参数。
编辑：OP指出此解决方案是错误的：
-nobrowser不会产生浏览器文件。有点令人困惑，但与完成计算后打开Web浏览器无关。
-nobrowser中有ChromHMM User Manual
选项。
-nobrowser –如果存在此标志，则不打印浏览器文件。如果请求-nobed，则浏览器文件写作也被抑制。
因此命令将是：
java -jar ChromHMM.jar LearnModel -nobrowser <inputdir> <outputdir> <numstates> <assembly>