ImageJ - 大脑半球标准化

Question

我有啮齿动物大脑的 MRI 图像文件。 同侧半球部分切片有病变。对侧健康。 我的目标：使用以下公式标准化 ImageJ 宏中的同侧半球：

（对立 - ipsi）/ ipsi

我开始分离每个半球，并将每个半球作为 MRI 图像（所有灰色阴影，周围环绕着 0.0 黑色像素值），并将每个半球作为二进制掩模（白色像素值 = 1，黑色 = 0）（ = 总共 4 个文件；如果需要的话，我还有两个半球的大脑）。

然后我在我的宏中尝试了这个：

imageCalculator("Subtract create 32-bit stack", mri_img_name_contra, mri_img_name_ipsi);
selectWindow("Result of "+mri_img_name_contra);
imageCalculator("Divide create 32-bit stack", "Result of "+mri_img_name_contra,mri_img_name_contra);

（之后，我会在结果图像上应用 ipsi 蒙版，仅保留 ipsi 一侧。然后“分析粒子”，以获得我的结果）。

我的问题：除以对比度值后，我得到一张黑色图像，其中像素仅为 1。 减去之后，一切似乎都很好。 在所有这些步骤中我可能会在哪里失败？

如果需要的话，这里有一些图像（所有这些都是 32 位图像）：

A：同侧脑部 MRI 图像； B：同侧脑膜图像； C：对侧脑MRI图像； D：对侧脑膜图像； E : 相减后的结果。

Answer 1

这是一个从上到下显示的蒙太奇：ipsi、contra、(contra-ipsi)。灰色背景对应于值零。较暗的部分是负极，较亮的部分是正极。