我正在使用igraph中的网络分析数据这是一个示例数据帧
df_edgelist=structure(list(Nominator = structure(c(6L, 4L, 7L, 8L, 1L, 2L,
3L, 5L), .Label = c("Andrea", "Dan", "Dan", "Greg", "Jerry",
"Jim", "Rachel", "Sarah"), class = "factor"), Nominee = structure(c(5L,
2L, 8L, 1L, 7L, 3L, 6L, 4L), .Label = c("Andrea", "Dan", "Greg",
"Jeff", "Jerry", "Jerry", "Sarah", "Tim"), class = "factor"),
Age_Nominator = c(24L, 25L, 29L, 45L, 43L, 67L, 67L, 45L)), class = "data.frame", row.names = c(NA,
-8L))
从文档here我得到的印象是graph_from_dataframe函数将第3列Age_Nominator视为顶点属性，如果我还提供另一个数据帧并在vertices的graph_from_dataframe参数中设置该数据帧的名称。这是正确的还是df_edgelist中的第3列仍然是边缘属性？
graph_from_data_frame感兴趣的两个论点是d和vertices。正如评论中所讨论的，d中的额外列将是边缘属性，而vertices中的额外列（第一列是顶点名称）将是顶点属性。
进一步，
如果
vertices不是NULL，那么d中给出的符号边缘列表将被检查为仅包含vertices中列出的顶点名称。
意味着d的前两列不能提及vertices中不存在的任何顶点。另一方面，如果vertices有一些额外的顶点，那将不会引起任何问题，它们将被简单地隔离。
例如，
df_vertices <- data.frame(someNames = c("NewName", as.character(unique(unlist(df_edgelist[, 1:2])))))
df_vertices$Age <- 20 + 1:nrow(df_vertices)
df_vertices
# someNames Age
# 1 NewName 21
# 2 Jim 22
# 3 Greg 23
# 4 Rachel 24
# 5 Sarah 25
# 6 Andrea 26
# 7 Dan 27
# 8 Jerry 28
# 9 Tim 29
# 10 Jeff 30
通过这种方式，我们考虑所有必要的顶点并添加额外的NewName。然后
g <- graph_from_data_frame(df_edgelist, vertices = df_vertices)
# V(g)$Age
# [1] 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30
V(g)$name
# [1] "NewName" "Jim" "Greg" "Rachel" "Sarah" "Andrea" "Dan" "Jerry" "Tim"
# [10] "Jeff"
E(g)
# + 8/8 edges from 7f024f1 (vertex names):
# [1] Jim ->Jerry Greg ->Dan Rachel->Tim Sarah ->Andrea Andrea->Sarah Dan ->Greg
# [7] Dan ->Jerry Jerry ->Jeff
正如所料。如果你想避免那些孤立的顶点，你可以改为指定vertices
df_vertices[df_vertices$someNames %in% as.character(unique(unlist(df_edgelist[, 1:2]))), ]
# someNames Age
# 2 Jim 22
# 3 Greg 23
# 4 Rachel 24
# 5 Sarah 25
# 6 Andrea 26
# 7 Dan 27
# 8 Jerry 28
# 9 Tim 29
# 10 Jeff 30