如何在 R 中对从 .csv 导入的大数据执行多项统计检验（即两侧 t 检验）？

Question

尝试对使用 csv 导入的数据执行 ttest。

数据如下：

具有 99 个基因的“正常”病例和“癌症”病例值。

我如何设置代码来统计比较“正常”和“癌症”值（每个类别 n=20） 分别为每一列？

这将是双边 t 检验，因此结果将显示： 基因1、基因2.....基因99的正常值和癌症值之间的统计差异。

我希望避免为每个单独的列查找均值、标准差等，并希望对我的数据进行集体测试。

Answer 1

我曾经在 R 基础上编写过一个函数来做到这一点。该函数在github上。

 remotes::install_github('oonyambu/SLR')
 SLR::multiple_tests(. ~ category, df)

例如

t.test

对于

iris

数据集：

 SLR::multiple_tests(.~Species, iris)