如何授予 R Shiny Server 在 Ubuntu 上渲染 Rmarkdown 的权限？

Question

我有一个 R Shiny 应用程序在 EC2 实例上的 Shiny Server 上运行。操作系统是Ubuntu。应用程序通过 GitHub Actions 和 CodeDeploy 从 GitHub 推送到 EC2 实例。

除了运行

shiny::downloadHandler

生成可供用户下载的 Word 文档的

rmarkdown::render

之外，该应用程序也能正常工作。

在我正在开发的机器上本地渲染和下载它没有问题。

但是，当应用程序在 EC2 实例上运行时按下下载按钮时，会打开一个新选项卡，但没有可供下载的文档。闪亮的日志状态：

processing file: report_template.qmd
Warning in file(con, "w") :
  cannot open file 'report_template.knit.md': Permission denied
Warning: Error in file: cannot open the connection
  1: runApp [/tmp/RtmpLLsUwv/R.INSTALLf0c038efa14b/shiny/R/runapp.R#388]

我已更改包含应用程序的

shiny-server

目录的文件权限，但我认为这不起作用，因为我相信权限错误一定位于临时文件中。

我也尝试了以下方法，但没有成功： https://deanattali.com/2015/05/09/setup-rstudio-shiny-server-digital-ocean/#shiny-user-perms

我还需要做些什么才能为用户

shiny

提供正确的权限吗？

Answer 1

我遇到了这个问题，我相信这是由于中间目录没有权限造成的（正如您也发现的那样）。我通过根据临时文件位置设置中间目录来解决这个问题。

这是我从下载处理程序中获取内容函数的方法：

  content = function(file){
    #use temp folder as intermediates directory to ensure permissions are available for the folder
    splitFile <- unlist(strsplit(file,'/'))
    intDir <- paste(splitFile[1:(length(splitFile)-1)], collapse = '/')
    
    #create report based on template
    res <- rmarkdown::render(
      "report.Rmd",
      output_file = file,
      intermediates_dir = intDir
    )
  }