渲染 Quarto 文档在包中找不到 .R 文件

Question

当我创建一个简单的 R 包时，我想在我的

test_doc.qmd

文件中使用在 .R 文件中创建的函数。问题是，在渲染 qmd 文件时，在包中创建该函数时找不到该函数。当我使用

devtools::load_all()

时它可以工作，所以我可以在代码块中找到该函数，而无需在控制台中手动运行它。我尝试在此 GitHub 存储库上创建一个可重现的示例：https://github.com/QuintenSand/test_package

因此，您应该首先克隆存储库，然后尝试运行 qmd 文件：

---
title: "Test quarto doc"
format: html
editor: visual
---

## Quarto

Test if the function will be rendered:

```{r}
test_function(TRUE)
```

函数 test_function 位于 test_function.R 文件中。渲染文档时返回以下错误：

processing file: test_doc.qmd
  |...................................                 |  67% [unnamed-chunk-1]


Quitting from lines 12-13 [unnamed-chunk-1] (test_doc.qmd)
Error in `test_function()`:
! could not find function "test_function"
                                                                                                            
Execution halted

但是当我跑步时

devtools::load_all()

：

devtools::load_all()
ℹ Loading test

代码块：

即使该函数不在全局环境中，您也可以看到它仍然有效。所以我想知道当文档中有 .R 自定义函数时我们如何渲染四开文档？

Answer 1

如果您确实需要包裹，那么您应该

1. 构建包并
2. 在四开源中使用

   library()

   加载包。

假设该包将被称为

test

（基于您的

DESCRIPTION

文件）：

---
title: "Untitled"
format: html
editor: visual
---

```{r}
library(test)
```

Test if the function will be rendered:

```{r}
test_function(TRUE)
```

或者，如果您只想使用特定文件中的函数，那么您可以将该文件的内容获取到您的 Quarto 源中。

---
title: "Untitled"
format: html
editor: visual
---

```{r}
source("test_function.R")
```

Test if the function will be rendered:

```{r}
test_function(TRUE)
```

如果

.R

文件位于子目录中（例如在示例存储库中），那么您需要将其包含在

source("R/test_function.R")

等路径中。