SQL Server中字符串的反向补码

Question

DNA序列的reverse complement是通过将字母A与T互换而将C与G互换而形成的第一步，然后颠倒整个拼写序列。例如，ACCTGAG的reverse为GAGTCCA（仅通过从末尾开始读取序列），而reverse complement为CTCAGGT（通过首先交换字母然后反转结果序列）。

如何在SQL Server中获得所需的reverse complement输出？为了方便起见，我提供以下SQL代码。

DECLARE @seq NVARCHAR(MAX)
SET @seq = 'ACCTGAG'

SELECT @seq AS [Sequence], REVERSE(@seq) AS [Reverse sequence]

---output---
Sequence    Reverse sequence
ACCTGAG     GAGTCCA

---Desired output---
CTCAGGT

Answer 1

听起来您可以多次使用replace()和reverse()：

select @seq,
       reverse(replace(replace(replace(replace(replace(replace(replace(replace(@seq, 'A', 'B'
                                                                          ), 'T', 'U'
                                                                  ), 'C', 'D'
                                                          ), 'G', 'H'
                                                  ), 'B', 'T'
                                          ), 'U', 'A'
                                  ), 'D', 'G'
                          ), 'H', 'C'
                   )
          )

Here是db <>小提琴。

这将基数替换为任意字母，然后将其放回相反的值。

Answer 2

如果您正在使用TRANSLATE，则可以尝试SQL Server 2017

DECLARE @seq NVARCHAR(MAX)
SET @seq = 'ACCTGAG'

SELECT @seq AS [Sequence], REVERSE(@seq) AS [Reverse sequence]

SELECT REVERSE(TRANSLATE(TRANSLATE(@seq,'A','T'), 'C', 'G')) AS Translated

尽管我同意拉努在上面的评论。您的逻辑得出GTGTGGT。除非误解了您的请求