R / RStudio：.libPaths（）不会附加或覆盖库树

Question

我需要在R中设置库路径一次使用（即我不想要，也不能在Rprofile.site中设置它，也不能将其他包放入默认库中）。

我尝试使用.libPaths()附加和覆盖库路径，但都没有工作;路径保持不变。看下面我的尝试。

由于我看到的例子与我的尝试有效，我觉得这可能是一个授权问题：我根本无权改变路径。

我搜索了stackoverflow，但问题/解决方案与我的问题不符。有什么建议？不，turning it off and on again不会帮助。

我的环境是Mac（High Sierra），R 3.4.3，RStudio 1.1.423，R newbie user（不是root）。

谢谢！

原始路径

> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library"
> .Library
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library"

试图追加

> .libPaths( c( .libPaths(), "<some_other_valid_path>") )
> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library"
> .Library
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library"

试图覆盖

> .libPaths("<some_other_valid_path>")
> .libPaths()
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library"
> .Library
[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources/library"

Answer 1

我想你只是困惑自己。只需添加一个目录即可：

R> .libPaths()
[1] "/usr/local/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/site-library" 
[3] "/usr/lib/R/library"           
R> .libPaths("/tmp")
R> .libPaths()
[1] "/tmp"                    "/usr/local/lib/R/site-library" 
[3] "/usr/lib/R/site-library" "/usr/lib/R/library"           
R> 

新的首先出现，因此将首先用于安装，或通过library()等进行搜索。

你不能从现有的会话中覆盖 - 就像切断你所坐的树枝一样。

但是看看help(Startup)。您可以使用其他文件，即使在每个当前目录级别也是如此。

Answer 2

感谢您的反馈，德克！我确实对.libPaths如何工作感到困惑，谢谢你的澄清。

根据您的示例，我意识到问题是我无法访问其他目录。 .libPaths()内部调用dir.exists()，由于不可访问性而返回false，因此新目录未添加到路径中。我只需要弄清楚如何提供访问权限。