如何用python创建多通道tif图像

Question

我有一组显微镜图像，每个子集都有两个通道，我需要将其合并为一个 .tif 图像（每个合并图像应包含两个通道）

import cv2 as cv

im1 = cv.imread('/img1.tif', cv.IMREAD_UNCHANGED)
im2 = cv.imread('/img1.tif', cv.IMREAD_UNCHANGED)

im3 = im1 + im2


cv.imwrite('img3.tif', im3)

这样它会创建一个具有一个通道的文件，但我想获得具有两个通道的 16 位 .tif 图像，例如可以在 ImageJ 中单独查看。有什么办法可以纠正吗？

Answer 1

奥尔加

也许使用 tifffile 将是一个解决方案

import cv2 as cv
import numpy as np
import tifffile as tiff 

im1 = cv.imread('/img1.tif', cv.IMREAD_UNCHANGED)
im2 = cv.imread('/img1.tif', cv.IMREAD_UNCHANGED)

merged_image = np.stack((im1, im2), axis=0)
print("Image shape:", merged_image.shape)

tiff.imwrite('img3.tif', merged_image, imagej=True)