R包函数中的标准评估与非标准评估

Question

有人建议，R-package函数内部的函数调用最好使用标准评估（see here），尤其要避免使用utils::globalVariables。

如果我使用dplyr包进行非标准评估，那么对于以下代码片段的标准评估的“转换”是什么 - 特别是对于table-command？

grp和dep是数据框mydf的数值，而x是一个因子。

非标准评估：

pvals <- mydf %>%
  dplyr::group_by(grp) %>%
  dplyr::summarise(N = n(),
    p = suppressWarnings(stats::chisq.test(table(x, dep))$p.value))

标准评估？

pvals <- mydf %>%
  dplyr::group_by_("grp") %>%
  dplyr::summarise_(N = n(),
    p = suppressWarnings(stats::chisq.test(table("x", "dep"))$p.value))

而且，与ggplot函数调用怎么样？ ggplot是否有标准评估支持？

编辑：添加了可重复的示例。

library(dplyr)
data(ChickWeight)
ChickWeight %>%
  dplyr::group_by(Diet) %>%
  dplyr::summarise(N = n(),
  p = suppressWarnings(stats::chisq.test(table(weight, Time))$p.value))

Answer 1

如果你不想使用dplyr，我会忽略codetools :: checkUsagePackage（）的误报。

Answer 2

您可以尝试永远不要在函数中对变量名进行硬编码，而是使用rlang quasiquotation。

从您的示例中，在函数上下文中，我会写：

#' Chisq table
#' @importFrom rlang enquo !!
#' @importFrom magrittr %>%
#'
#' @param data Dataset
#' @param x,y,group bare variable names
#' @export
chisq_table <- function(data, x, y, group){
  x <- enquo(x)
  y <- enquo(y)
  group <- enquo(group)

  data %>%
    dplyr::group_by(!!group) %>%
    dplyr::summarise(
      N = dplyr::n(),
      p = suppressWarnings(stats::chisq.test(table(!!x, !!y))$p.value)
    )
}

data(ChickWeight)
chisq_table(data = ChickWeight, x = weight, y = Time, group = Diet)

## # A tibble: 4 x 3
##   Diet      N        p
##  <fct> <int>    <dbl>
## 1 1       220 4.42e-16
## 2 2       120 3.76e- 7
## 3 3       120 4.74e- 6
## 4 4       118 1.33e- 5

检查包时不会触发注释，如果数据集中的列名发生更改，则可以更轻松地维护函数。