创建填充气泡/散点图

Question

我遇到过许多图（页末），它们与散点图/群图非常相似，它们会抖动 y 轴以避免重叠的点/气泡。

如何根据给定的一组 x 和 z 值（点大小）获取 y 值（最好是数组）？

我找到了 python

circlify

库，但它并不完全是我想要的。

编辑：对于这个项目，我需要能够输出

x, y and z

值，以便可以在用户选择的工具中绘制它们。因此，我对生成 y 坐标的解决方案更感兴趣，而不是实际的绘图。

Answer 1

答案：
您在文本中描述的内容被称为

swarm plot

（或

beeswarm plot

），并且有这些的 python 实现（特别是参见 seaborn），但也有，例如，在 R 中。也就是说，这些图允许调整每个数据点的 y 位置，这样它们就不会重叠，但在其他方面会紧密排列。

Seaborn 群体图：

讨论：
但是您显示的图不是标准的群图（几乎总是有看起来怪异的“手臂”），而是似乎由某种类型的物理引擎驱动，该引擎允许沿 x 和 y 运动，从而产生您在图中看到的紧密排列的结构（例如，像蜘蛛网上的水滴）。

也就是说，在上图中，通过想象仅沿垂直轴移动点以使其包装得更好，您可以看到，在大多数情况下，您实际上无法做到这一点。 （老实说，也许显示的数据可以包装得更好一些，但不会太显着——例如，左边的第一条手臂无法改进，如果其中任何一个可以改进，也只能通过向内移动一两个点来实现） ）。相反，为了得到像你展示的那样的图，你需要在

x

中进行一些运动，就像某种类型的物理引擎给出的那样，它希望使 x 接近其原始值，但也允许一些变化。但这是需要在数据级别而不是编程级别上决定的权衡。

例如，这里是一个绘图库，RAWGraphs，它会生成一个紧凑的蜂群图，就像问题中的 Politico 图一样：

但至关重要的是，他们发出了警告：
“重要的是要记住，Beeswarm 图使用力来避免视觉模型的单个元素之间的碰撞。虽然这有助于查看可视化中的所有圆圈，但它也会造成一些情况，其中 圆圈未放置在可视化中它们应该位于 X 轴线性刻度上的确切位置。”

或者，类似地，在这个

这个 D3 包中的注释中：“其他实现使用力布局，但力布局模拟自然会尝试通过沿两个轴推动数据点来达到平衡，这可能会破坏数据点的顺序数据。” 这是一个基于 D3 力布局的精彩演示，其中滑块调整将点拉至正确值的相对力。

因此，该图是群图和小提琴图（显示分布包络线的平滑平均值）之间的折衷方案，但这两个图都真实地表示了数据，并且在这些图中，这些紧密排列的图表示的代价是错误表示各个数据点的 x 位置。它们的优点似乎是您可以对各个点进行着色并单击（如果您愿意，您可以在其中提供实际的 x 数据，尽管这在链接图中没有完成）。

Seaborn 小提琴情节：

就我个人而言，我真的很犹豫是否以某种未知的方式歪曲数据（这是物理引擎计算的结果，但对读者来说并不明显）。也许更好的折衷方案是使用充满非圆形补丁的小提琴，或者类似

Raincloud情节。

Answer 2

我创建了

一个可观察的笔记本来计算具有可变大小圆圈的蜂群图的 y 值。下图给出了结果示例。

如果您需要在脚本中使用 JavaScript 代码，则可以直接复制并粘贴

AccurateBeeswarm

 类的代码。

该算法只是将点逐一放置，尽可能靠近 x=0 线，同时避免重叠。还可以选择添加一点随机性来改善外观。 x 值永远不会改变；这是这种方法相对于力导向算法（例如 RAWGraphs 使用的算法）的一大优势。