我正在尝试使用miniconda3导入scanpy以用于jupyter笔记本。但是，当我尝试导入scanpy时，它会提供有关hdf5extension dll的ImportError。当我查看包表的目录时，我可以看到两个名为hdf5.dll和hdf5extension.cp37-win_amd64.pyd（https://gyazo.com/a7d5a9d7d28756a8d82bc060b33b91ca）的文件。我假设这些是应该导入的文件，但我不明白导入的问题。
我之前在这个系统上使用过scanpy，但是在我通过conda安装h5py之后就出现了问题（如果你通过conda安装了scanpy，则不知道会自动包含h5py）。所以首先我卸载了h5py，但是没有用。卸载并重新安装miniconda3两次，这也没有用。手动设置$ PATH变量也无济于事。
然后我查看了traceback中引用的file.py，并发现tables目录中应该有一个文件。我发现了这些文件，并认为它们可能是错误的命名，所以我尝试更改名称，这也没有用。将python从3.7.1降级到3.6.6不起作用，也没有使用python 3.6.6在conda中创建新的env并安装所有必需的包。
使用带有miniconda3安装程序的conda 4.5.12在64位Windows 7上运行。
Python 3.6.6 |由conda-forge打包| （默认情况下，2018年7月26日，11：48：23）win32上的[MSC v .1900 64 bit（AMD64）]输入“help”，“copyright”，“credits”或“license”以获取更多信息。
import scanpy
Traceback（最近一次调用最后一次）：
文件“”，第1行，文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ scanpy__init __。py”，第11行，
来自。导入工具为tl
文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ scanpy \ tools__init __。py”，第12行，in
来自.sim import sim
文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ scanpy \ tools \ sim.py”，第19行，in
from .. import readwrite
文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ scanpy \ readwrite.py”，第9行，in
导入表
文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ tables__init __。py”，第131行，in
来自.file import File，open_file，copy_file
文件“C：\ Miniconda3 \ envs \ py36 \ lib \ site-packages \ tables \ file.py”，第35行，
来自。 import hdf5extension
ImportError：DLL加载失败：找不到指定的过程。
我遇到了同样的问题，两次。
这似乎是Windows特有的问题。我的第一个解决方案是更新我的Visual Studio版本，它带有可能需要以某种方式运行scanpy的C-Build Tools（？）。这工作好一段时间了。
几周后，我再次遇到了相同的ImportError。这一次唯一有用的是使用旧版本的h5py（2.8）。设置新的虚拟环境或重置Miniconda软件包没有帮助，specifying the hdf5-DLL save location也没有作为Windows变量。
我的建议是h5py版本2.9中的新hdf5库与Microsoft VS的当前C编译器尚不兼容。
希望这可以帮助！