我对网络编程还很陌生,所以如果我遗漏了一些明显的东西,请耐心等待。我使用 html、css 和 javascript 来可视化不同的 DNA 序列。每个序列都表示为 html 元素图,并且具有与 DNA 序列长度相对应的固定长度。跨度位于每个图中的固定点以表示某些主题。此类图的代码如下所示(使用 django 作为我的 Web 框架):
<div class="graph" style='--graph-length: {{sequence_length}}'>
<hr class="line">
{% for key, value2 in value.items %}
{% if value2.start_position %}
<span class='motif' style="--start: {{ value2.start_position }}; --stop: {{ value2.stop_position }};"></span>
{% endif %}
{% endfor %}
</div>
像这样,我在网页上创建了多个序列的表示,一个在另一个下面。现在,其中一些序列可能彼此相似。我想以图形方式显示序列与其下方显示的序列相似的区域,如下所示:
在上面的示例中,graph1 和 2 以及 graph2 和 3 表示的序列具有相似的区域,但序列的总长度(以及因此图表上表示的图案的显示大小)不同,导致蓝色元素更宽在图2和图3之间。
因此,对于每个图,我所拥有的是每个图应表示的序列长度、相应图上每个主题的开始和结束位置,以及每个图上相似区域的开始和结束位置(如果两个图(序列)包含)类似的区域(图中绿色)。
所以我的问题是:如何使用 html、css 或 javascript 创建表示两个图形(图中蓝色)之间相似区域的元素? (或者我可以在已有的内容中实现的任何其他内容)
感谢任何有关我如何解决此问题的提示,如果您有更多问题,请告诉我!
编辑:我实际上更喜欢 svg 中的解决方案,因为我认为它更适合集成到我的应用程序中
您可以使用 svg 或 canvas。
这是使用画布的极简主义方法。您可能想要依赖一个“非常”可能提供与您的图表接近的图表的库。 但是刮伤永远不会痛。
下面,每个图负责正确缩放其轴。
最终,梯形依靠它们所依赖的图来缩放相应的顶点。
您可能希望更有条件地显示
text,因此可以使用 Bar 并可能给它一个布尔值来指示是否应显示它。 您可以通过调整笔划线等的重量来进一步设置画布样式,但这只是一个演示,向您展示您可以轻松完成它
const canvas = document.querySelector('canvas')
let ctx = canvas.getContext('2d')
let bars = [
[Bar(200, 300), Bar(1800,2300), Bar(2500, 4500), Bar(5000,5200), Bar(8000,8500)],
[Bar(1100,1300), Bar(3000, 3800), Bar(4000, 4200), Bar(7000, 7500)],
[Bar(1, 2700)]
]
function Bar(a,b){return [a, b]}
class Graph{
constructor ({anchorY, width, min, max}) {
this.anchorY = anchorY
this.width = width
this.dw = width / (max - min )
this.min = min
this.max = max
}
plot (bars) {
// plot bars
// resize bars dimension to fit canvas
const e = 5
ctx.fillStyle = 'orange'
const scaledBars = bars.map(([a, b]) => [ a, b, a * this.dw, b * this.dw ])
scaledBars.forEach(([_, dum, left, right])=>{
ctx.fillRect(left, this.anchorY - e, right - left, 2*e)
})
// plot line
ctx.strokeStyle = 'black'
ctx.beginPath()
ctx.moveTo(0, this.anchorY)
ctx.lineTo(this.width, this.anchorY)
ctx.closePath()
ctx.stroke()
ctx.strokeStyle = 'green'
ctx.font = '10px serif'
scaledBars.forEach(([origLeft, origRight, left, right]) => {
ctx.strokeText(origLeft, left, this.anchorY - 10)
if (right - left > 100 ) {
ctx.strokeText(origRight, right, this.anchorY - 10)
}
})
}
//x will be shifted automatically
moveTo (x) {
ctx.moveTo(x * this.dw, this.anchorY)
}
lineTo (x) {
ctx.lineTo(x * this.dw, this.anchorY)
}
}
const graphs = [
new Graph({anchorY:100, width: canvas.width, min: 1, max: 10000}),
new Graph({anchorY:200, width: canvas.width, min: 1, max: 8500}),
new Graph({anchorY:300, width: canvas.width, min: 1, max: 4000})
]
// g first graph, (a,b) left, right anchors in first graph
// g2 second graph, c right anchor, d left anchor in second graph
function trapeze(g, a, b, g2, c, d){
ctx.beginPath()
g.moveTo(a)
g.lineTo(b)
g2.lineTo(c)
g2.lineTo(d)
ctx.closePath()
ctx.fillStyle = 'rgba(84, 147, 158, 0.5)'
ctx.fill()
}
const [g1, g2, g3] = graphs
const trapezes = [
[g1, 1800, 4500, g2, 3800, 1100],
[g1, 8000, 8500, g2, 7500, 7000],
[g2, 1100, 3800, g3, 2700, 1],
]
trapezes.forEach(t => trapeze(...t))
graphs.forEach((g, i) => {
g.plot(bars[i])
})
canvas{background:#eeeeee;}
<canvas width="400" height="400"></canvas>