我正在用R库做重复测量方差分析。
library(ordinal)
library(car)
library(RVAideMemoire)
我有两个组: 月和距离,因变量是二氧化碳。
距离 月份 CO2
0米 7月 234
我做了一个由距离、月份以及月份和距离之间的交互作用来解释二氧化碳的clmm模型,结果显示月份和距离都有显著性,但没有交互作用。
model_CO2 = clmm(CO2.f ~ month + distance + month:distance + (1|nest),
data = field_data,
threshold = "equidistant")
结果显示,月份和距离都是显著的,但没有交互作用。 现在,我想用这些信息做一个Tukey检验,所以我的想法是对每个因素分别做一个Tukey检验。
我的问题是:我是否需要再做一个模型?
我必须做另一个模型,其中我分开每个因素?或者我可以用我创建的模型进行Tukey检验,但只考虑一个因素?
例子:我可以用我创建的模型进行Tukey检验,但只考虑一个因子吗?
使用初始模型
library(emmeans)
library(lsmeans)
Tmonth = lsmeans(model_CO2,
~ month)
multcomp::cld(Tmonth,
alpha = 0.05,
Letters = letters,
adjust = "tukey")
创建一个新的模型,只考虑月份,然后进行Tukey检验。
model_CO2m = clmm(CO2.f ~ month + (1|nest),
data = field_data,
threshold = "equidistant")
Tmonth = lsmeans(model_CO2m,
~ month)
multcomp::cld(Tmonth,
alpha = 0.05,
Letters = letters,
adjust = "tukey")
先谢谢你
我想有人会建议你这样做。但不,你不需要 有 到,因为你所比较的估计边际均值是很明确的;交互作用效应只是平均值。
但我建议你绘制各因素组合的估计值--使用 emmip()
例如--这样你就能清楚地了解被平均的估计是什么。
我刚刚在问题中注意到,你把模型中的一个因素完全剔除了。我绝对建议 与...对抗 这样做。每个因素都贡献了一个显著的主效应,所以它们都属于模型。如果你要在这里考虑一个缩小的模型,只考虑有两个主效应但没有交互作用的模型。