从 R 脚本捕获执行结果

Question

我有一个从 Python 调用的 R 脚本，我想捕获它的输出。我可以写入 CMD 以及 TXT，但我想捕获 Python 脚本中的输出，以便我可以使用它。

在 python 脚本中我尝试过：

logging.debug (os.popen ('Rscript testScript.r'))

但这不起作用。我也尝试过：

output = cmd ('Rscript testScript.r')

print (output)

但它返回 None 作为输出。

在 R 中我尝试过：

returnValue (TRUE)

但它写入 CMD，并且输出仍然是 None。

如何让 R 脚本返回一个可以过滤以查看结果的值???

提前非常感谢您。

Answer 1

我找到了解决方案：

在 R 中，我们可以将选项放在

Try/catch

中

  error = function (cond)

这反映了在 Python 中我们可以收集的输出：

  print (stderr)
  print (stdout)

其中

stderr

是输出误差，

stdout

是标准输出。

希望有类似问题的人能有所帮助。

Answer 2

在寻找同一问题的解决方案时，我遇到了使用

out <- "some string or dataframe or anything else"
write(out, stdout())

在 R 中。

根据你的Python示例：

import subprocess
output = subprocess.run(
    ['Rscript' 'testScript.r'],
    capture_output = True,
    text = True
    )
print(output.stdout)

所需的输出将存储在 stdout 属性中。