在AWS EC2上安装和使用依赖于rJava的库

Question

我正在使用可用的机器映像here来支持EC2上的RStudio服务器，我将在其上运行分析，部分使用xlsx和rvest，这两者都需要Java和R进行合作，而这些都不是开箱即用的。我搜索了一些解决方案并试图实现它们，但几乎无处可去。

我通过SSH连接到机器，然后进入java -version并得到了这个：

The program 'java' can be found in the following packages:
 * default-jre
 * gcj-5-jre-headless
 * openjdk-8-jre-headless
 * gcj-4.8-jre-headless
 * gcj-4.9-jre-headless
 * openjdk-9-jre-headless
Try: sudo apt install <selected package>

所以我不知道该怎么做。我尝试运行sudo apt-get install r-cran-rjava，这也是在StackOverflow上推荐的，并且出现了这个错误：

Reading package lists... Done
Building dependency tree       
Reading state information... Done
E: Unable to locate package r-cran-rjava

同样当我尝试运行sudo R CMD javareconf时，这就是我得到的：

*** JAVA_HOME is not a valid path, ignoring

*** Cannot find any Java interpreter
*** Please make sure 'java' is on your PATH or set JAVA_HOME correspondingly

我搜索了它存储在这里的Java：java: /usr/share/java，我不确定如何正确设置JAVA_HOME，或者如何正确设置Java。

我该怎么办？

Answer 1

安装RJava（Ubuntu）

首先，我们需要Java本身，检查它是否已安装

写在终端：java -version

但你已经检查过了，所以你需要安装它。

如果它返回程序java可以在以下包中找到，那么Java还没有安装，所以执行以下命令：sudo apt-get install default-jre。这将安装Java Runtime Environment（JRE）。

然后安装JDK

写在终端：sudo apt-get install default-jdk

然后使用R安装JDK

在终点站运行：sudo R CMD javareconf

安装RJava和Rgdal

执行：sudo apt-get install r-cran-rjava

然后：sudo apt-get install libgdal1-dev libproj-dev

在RStudio中安装包

在RStudio中运行：install.packages("rJava")

完成！