是否有测试或函数可以对大数据集进行多重比较？

Question

我有一个包含 2304 个值的大数据集：384 个不同的基因表达值，一式三份，针对 2 个不同的组（即不同的治疗）。我只想比较两组之间相同的基因：例如，基因 A 处理与基因 A 对照，等等......并获得 p 值。我不是想比较不同的基因！

所以我正在运行这个命令：

data2 %>%
group_by(group) %>%
wilcox_test(expression ~ gene) %>%
adjust_pvalue(method = "BH") %>%
add_significance()

但是，在 R 上运行需要一生的时间，所以我正在为这个特定问题寻找更好的函数？

谢谢

Answer 1

我使用了适合我的数据分布并考虑多个因素的 GLM，而不是使用 Wilcoxon 检验。