我使用 Oracle 数据库中的数据开发了一个闪亮的应用程序，我的应用程序在我的 Windows 环境中开发并顺利运行。为了在我的大学中部署我的应用程序，我将其编写为一个包，并将该包安装在 ubuntu 服务器上。 Ubuntu 18.04.2 LTS（GNU/Linux 4.15.0-50-通用 x86_64） Shiny 服务器已安装并找到包，应用程序正在运行。
但是当我尝试创建与 Oracle 的连接时，我的应用程序断开连接并要求我重新加载会话。
因此，我只提取了构建连接的代码并包含了几条消息，并且在使用 RJDBC 包中的 dbconnet 时它会挂起。
我检查了几个环境变量，如 PATH、JAVA_HOME、LD_LIBRARY_PATH。我几乎没有 Linux 经验。
我的R版本 R版本3.6.0（2019-04-26）——《种一棵树》 版权所有 (C) 2019 R 统计计算基金会 平台：x86_64-pc-linux-gnu（64位）
Java版本 openjdk版本“11.0.3”2019-04-16 OpenJDK运行环境（build 11.0.3+7-Ubuntu-1ubuntu218.04.1） OpenJDK 64位服务器虚拟机（build 11.0.3+7-Ubuntu-1ubuntu218.04.1，混合模式，共享）
Oracle 数据库 Oracle Database 11g 企业版版本 11.2.0.2.0 - 64 位生产版
我正在使用驱动程序 ojdbc7.jar，因为它似乎是最新版本。
library(rJava)
library(DBI)
library(RJDBC)
options(java.parameters="-Xmx2g")
.jinit()
print(.jcall("java/lang/System", "S", "getProperty", "java.version"))
initialize_db_con <- function(driverClass = 'oracle.jdbc.driver.OracleDriver',
classPath = "pathtomyfile/ojdbc7.jar",
dbn = 'jdbc:oracle:thin:@xx.xx.xx.xx:xxxx/mydb',
usr = NULL, pwd = NULL) {
driverClass <- 'oracle.jdbc.driver.OracleDriver'
message("Setting user and password manually")
creds <- list(user = usr, pw = pwd)
drv <- RJDBC::JDBC(driverClass = driverClass, classPath = classPath, identifier.quote = '´')
message("driver is set")
con <- RJDBC::dbConnect(drv = drv, dbn, creds$user, creds$pw)
message("connection has been build")
return(con)
}
usr <- "myuser"
pwd <- "mypassword"
con <- initialize_db_con(usr=usr, pwd = pwd)
等待大约 30 秒后，出现此错误消息。
Error in .jcall("java/sql/DriverManager", "Ljava/sql/Connection;", "getConnection", :
ignoring SIGPIPE signal
为什么无法建立连接，有什么建议吗？
我知道这已经很旧了，提出这个问题的用户很久以前就已经离开了，但为了以防万一有人遇到同样的问题，我将发布我的解决方案：我通过添加这一行解决了它：
options(java.parameters="-Djava.security.egd=file:///dev/urandom")
library(rJava)
显然，由于 /dev/random 的阻塞特性，Linux 上的 JDBC 驱动程序存在问题。 tcpdump 跟踪显示流量，但在“auth session”TNS 数据包后连接被卡住。 strace 显示进程已锁定，等待 /dev/random:
open("/dev/random", O_RDONLY) = 22
...
read(22, 0x7ffc27416f10, 8) = ? ERESTARTSYS (To be restarted if SA_RESTART is set)
谷歌搜索一下就完成了剩下的事情。我已经被困在这个问题上好几天了，这就是我希望发布在这里的答案，所以就在这里。