Rideogram 未将 svg 导出为 pdf 或 png (RStudio)

Question

我一直在尝试使用 RIdeogram 制作同线性图，当我尝试导出报告时，它在另一台计算机上使用相同的代码和文件，但在我的计算机（Windows 10）中工作

“警告消息：在 checkValidSVG(doc, warn = warn) 中：该图片不是由 Cairo 图形生成的；可能会导致错误”

并且文件是空的。它还创建了一个包含此内容的 html

“此 XML 文件似乎没有任何与之关联的样式信息。文档树如下所示。”

以及图像的代码。

我用过这个代码：

install.packages("RIdeogram")
require(RIdeogram)
karyotype_dual_pcul_ranat <- read.csv("cariotipos/karyotype_dual_pcul_ranat.csv", sep = ";")
table(karyotype_dual_pcul_ranat$species)
synteny_pcul_ranat <- read.csv("synteny/synteny_pcul_ranat.csv", sep = ";")
head(synteny_pcul_ranat)
ideogram(karyotype = karyotype_dual_pcul_ranat, synteny = synteny_pcul_ranat)
convertSVG("chromosome.svg", device = "pdf")

我尝试更新 R 和软件包、安装 Cairo、将图形配置从默认更改为 Cairo。我也尝试过用 svglite 制作 svg 图像，效果很好。 请问有人可以告诉我发生了什么事吗？

Answer 1

我也有同样的问题；切换到“tiff”似乎有效。

convertSVG（paste0（species1，“_”，species2，“_sinteny.svg”），设备=“tiff”，dpi = 1200）