问题的简短版本:如何使用ddply汇总按几个变量分组的数据框?
我目前使用此代码按条件汇总:
ddply(ExampleData, .(Condition), summarize, Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))
如何调整代码以通过两个变量(条件和块)进行汇总?
期望的输出格式如下:
Condition Block Average SD N Med
1 A 1 0.50 .. .. ..
2 A 2 0.80 .. .. ..
3 B 1 0.90 .. .. ..
4 B 2 0.75 .. .. ..
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使用示例数据的问题的更长版本。
数据帧:
ExampleData <- structure(list(Condition = c("A", "A", "A", "B", "B", "B"), Block = c(1,
2, 1, 2, 1, 2), Var1= c(0.6, 0.8, 0.4, 1, 0.9, 0.5)), row.names = c(NA,
6L), class = "data.frame")
这是:
Condition Block Average SD N Med
1 A 1 0.6
2 A 2 0.8
3 A 1 0.4
4 B 2 1.0
5 B 1 0.9
6 B 2 0.5
我意识到有其他方法可以得到摘要,但如果我理解如何调整我的功能,这对我的学习会有好处。我只是没有成功使它工作,我无法找到一个例子来帮助我在stackoverflow。我正在寻找类似的东西:
ddply(ExampleData, .c(Condition,Block), summarize, Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))
(或。(条件*块)或列表(条件,块)或...... ??)
只需删除.variables
参数中的c,所以您的代码是:
library(plyr)
ddply(ExampleData, .(Condition, Block), summarize, Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))
顺便说一句,你可能想切换到使用dplyr
而不是plyr
。 https://blog.rstudio.com/2014/01/17/introducing-dplyr/
如果你在dplyr
这样做:
summarize(group_by(ExampleData, Condition, Block), Average=mean(Var1, na.rm=TRUE), SD=sd(Var1),N=length(Var1), Med =median(Var1))
您也可以使用管道,这可能是:
ExampleData %>%
group_by(Condition, Block) %>%
summarise(Average=mean(Var1, na.rm=TRUE),
SD=sd(Var1),
N=length(Var1),
Med =median(Var1))