根据多种模式过滤多字符串文件

Question

以下 Awk 脚本应打印输入文件中的所有字符串，但以“HETATM”开头并包含同一字符串“lig”或“lih”模式中某处的字符串以及从“结尾”。最后它应该在过滤文件的末尾添加“END”：

awk '!/^HETATM/ && /lig|lih |^END/; END {print "END"}' test.pdb >> ./processed.pdb

但实际上它删除了几乎所有生成空文件的行，末尾带有

END

，从而过滤了所有字符串。一个可能的解决方案：

awk '!/^HETATM.*(lig|lih)/ && !/^END/; END {print "END"}'

它能正常工作吗？

Answer 1

应在过滤后的文件末尾添加“END”

请记住，在 GNU 中，

AWK

END

在处理所有文件后触发，而不是

ENDFILE

，简单的示例让

file1.txt

、

file2.txt

和

file3.txt

内容分别为

1

，

2

，

3

然后

awk '{print}ENDFILE{print "endfile"}END{print "end"}' file1.txt file2.txt file3.txt

提供输出

1
endfile
2
endfile
3
endfile
end

如果您保证始终只有 1 个文件将被塞入您的 awk 命令，您可能会立即忽略此细节。

（在 GNU Awk 5.1.0 中测试）