如何在 bash 脚本中查明 conda 是否已在计算机上可用？

Question

我想创建一个bash脚本来在conda中安装一个新的虚拟环境“ABC”。但在我继续运行命令来创建此环境之前，我想检查计算机上是否已安装 conda。如果没有安装，我想安装 miniconda，然后创建环境“ABC”。如果 conda 已经安装，那么我将继续创建环境。 （所有这些都应该发生在同一个脚本中） 我只是想知道是否可以在 bash 脚本中检查 conda 是否存在，然后继续进行其余的安装？

'''

#!/bin/bash
<code_to_check_existence_of_conda_env_here ?>
//If it does not exist, I will run the below code
mkdir -p miniconda3
wget https://repo.anaconda.com/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh -O 
miniconda3/miniconda.sh
bash miniconda3/miniconda.sh -b -u -p ~/miniconda3
conda env update -f my_env.yml

'''

Answer 1

这里的主要问题是 Conda 有多个组件。加载哪些组件取决于 Conda 的安装方式以及 BASH 脚本在哪个用户下执行。我将尝试描述组件，希望您可以决定哪些组件适合验证。

康达组件

1：康达套餐

第一个是Python包

conda

，安装在Anaconda/Miniconda/Miniforgebase环境中。 如果base环境已激活，可以测试

python -m conda

这会给出类似的东西

/path/to/python: No module named conda

如果它不存在。否则，它会输出

conda

入口点的文档。

2：Conda 入口点

充当 CLI 的入口点

conda

位于 Anaconda/Miniconda/Miniforge 安装的

condabin

目录下。当用户运行

conda init

时，托管部分将添加到其 shell 初始化文件（对于 Linux BASH 为

.bashrc

），其中包括将

condabin

添加到 PATH 的代码。这很可能是OP想要识别的，但是，使用 shebang

/bin/bash

运行将不会加载

.bashrc

文件。相反，人们可能应该使用

#!/bin/bash -l

或

#!/usr/bin/env bash -l

然后可以使用

定位入口点

which conda

3：Conda 激活

最后，Conda 还包含一些 shell-only 函数，这些函数在前面提到的 shell 初始化代码中定义。这会设置一个中间人 shell 函数，也称为

conda

（本质上是一个别名），可以使用

查看

type conda

此函数用于确定是否正在请求

conda (de)?activate

命令，这些命令是纯 shell 函数，还是需要转发到入口点的内容。

推荐

如果我设计这个，我会编写一个交互式脚本来检查#2（

which conda

），如果它显示为空白，则提示用户提供Conda入口点的路径（也许他们安装了它）在一个奇怪的地方或者没有运行

conda init

）或安装Miniforge。¹

我也不会使用 base 环境来安装东西 - 这对于最终用户来说是一个坏主意，更不用说第三方 - 而是创建一个新环境。我会提示用户使用特定的默认环境名称，但也会提供一个选项供他们自定义。

---

[1] 是的，Miniforge，不是 Miniconda。 Anaconda defaults 通道的商业用途现在需要付费许可证，因此最好使用免费的 Miniforge。

Answer 2

我不太擅长 bash 脚本编写，但我会执行一个命令：

pip3 freeze | grep conda

并根据输出（如果退出状态是否错误）安装它或直接创建环境。

Answer 3

在你的机器上运行命令

conda list

，安装和未安装时的输出会有所不同，然后在输出上运行 if 语句。

Answer 4

在bash中，如果我们想检查某个软件是否安装，可以使用以下检查。

if dpkg -l $SOFTWARE; then
<Do stuff>

Answer 5

确保康达

这听起来像是实验工具

ensureconda

旨在解决的预期问题。然而，这需要使用 pip 安装 Python：

pip install ensureconda

以下是命令选项：

$ ensureconda --help
Usage: ensureconda [OPTIONS]

  Ensures that a conda/mamba is installed.

Options:
  --mamba / --no-mamba            search for mamba
  --micromamba / --no-micromamba  search for micromamba, install if not
                                  present
  --conda / --no-conda            search for conda
  --conda-exe / --no-conda-exe    search for conda.exe / conda-standalone,
                                  install if not present
  --no-install                    don't install conda/mamba if no version can
                                  be discovered
  --min-conda-version VERSIONNUMBER
                                  minimum version of conda to accept (defaults
                                  to 4.8.2)
  --min-mamba-version VERSIONNUMBER
                                  minimum version of mamba/micromamba to
                                  accept (defaults to 0.7.3)
  --help                          Show this message and exit.

Answer 6

类型

conda activate

或

conda activate env_name

第一个命令将激活基本环境（如果已经安装）。第二个命令将激活用户创建的环境（如果已安装）。

Answer 7

安装

miniconda

时，会出现一条消息，

You have chosen to not have conda modify your shell scripts at all.
To activate conda's base environment in your current shell session:

eval "$(/root/miniconda3/bin/conda shell.YOUR_SHELL_NAME hook)"

To install conda's shell functions for easier access, first activate, then:

conda init

因此查找目录

/root/miniconda3/

是否存在。