为什么我在导入scanpy._compat时出现错误？

Question

你好，我是新来的，所以很抱歉，我的语言可能会导致不准确.我在conda环境下工作，我安装了scanpy。然而，当我导入scanpy._compat模块时，它返回一个导入错误。

from scanpy._compat import Literal

ModuleNotFoundError: No module named 'scanpy._compat'

我试图升级scanpy._compat模块。pip install --upgrade scanpy 我还按照scanpy github上的安装步骤创建了另一个conda环境(https:/github.comtheislabscanpyblobmasterdocsinstallation.rst。). 在后两种情况下，除了导入scanpy._compat模块外，一切都很好。

有人知道我是否做错了什么吗？

Answer 1

在 _compat.py 你会注意到，我们提供了以下代码。

第一：

try:
    from typing import Literal

而对于异常，

except ImportError:
    try:
        from typing_extensions import Literal
    except ImportError:

        class LiteralMeta(type):
            def __getitem__(cls, values):
                if not isinstance(values, tuple):
                    values = (values,)
                return type('Literal_', (Literal,), dict(__args__=values))

        class Literal(metaclass=LiteralMeta):
            pass

因此，当你试图 import Literal你也可以通过以下方式来规避这个问题。importing typing 并做 typing.Literal (python版本 >3.8 )，不管你想把代码应用在什么情况下。

然而，这个问题表明 scanpy 根本无法导入。确保在安装环境后也要激活它。

$ conda info --envs 要知道你所拥有的环境的名称$ conda activate [relevant env name] 来激活相关的conda环境。

然后再次尝试代码。

$ python 进入pythoninterpreter

> from scanpy._compat import Literal 来测试导入是否有效。