MDS绘图轴如何与S：N比率相关？

Question

假设我有一个MDS图，如下所示：

现在，说MDS图中的所有内容看起来完全相同（彩色点的位置不会改变）。但只有一件事发生了变化：x轴（“第一维”）：

1）如果x轴限制从-200到100（而不是当前的-100到50），并且点都显示彼此相同的距离，我们可以说S：N比率更好（即组间分离得更好）因为x轴限制较大？

2）如果在一种情况下，x轴解释了25％的变化，但在另一种情况下，x轴解释了75％的变化，如果这两个点在两种情况下都显示相同的距离，我们可以说在第二种情况下，S：N比率更好，因为点（样本）之间的距离可以通过更多的变化来解释？

感谢您提出这些问题的想法！

Answer 1

我认为你不能像那样解释这些轴。 MDS只是一种将在三维空间中分离的点扭曲成二维的方法。您不能确定每个轴在MDS中解释的比例与其他约束方法（PCA等）不同。相反，您提供了R统计量，当R统计量超过0.20时，这意味着您的MDS很难表示之间的差异点。

对不起，我无法提供更“数学”的答案。