表示脱氧核糖核酸的核苷酸序列的字符串，该核酸序列保存构成遗传密码的基因。
如何使用 Bash 脚本查找 FASTA 文件的 GC 内容？
我想使用 Bash 脚本从 FASTA 格式文件中查找 GC 内容。 GC含量基本上是((G+C)的数量)/((A+T+G+C)的数量)。 我正在尝试使用 wc 命令。 ...
根据常见子模式对短的同质字符串（DNA）进行聚类并提取类的共识
任务： 将大量短 DNA 片段聚类到共享共同子序列模式的类别中，并找到每个类别的共有序列。 泳池：约。 300 个序列片段 8 - 20 让...
创建一个采用 2 个 DNA 序列的函数，检查它们是否具有相同的长度、是否是有效序列以及它们具有什么类型的突变
我正在尝试创建一个函数，它接受 2 个 DNA 序列作为参数并检查 3 件事（按此顺序）： 比较它们以查看它们的长度是否相同 检查它们是否都有效
我正在尝试比较两个有摆动的 DNA 序列并报告不匹配情况。为了在编程意义上解释 DNA 和摆动，它们是字符（碱基）A、T、C 和 G 的字符串，摆动是字符...
我有一个 DNA 序列，想使用 Python 获得它的反向互补序列。它位于 CSV 文件的其中一列中，我想将反向补码写入同一列中的另一列
我正在运行 msa 包来为 phangorn 包创建 DNA 对齐，但它因此错误而崩溃 我在 M1 Mac Book Pro 上运行带有 R v4.3.1 的 RStudio 多 <- msa(seqs, method=&...
我的程序在所有情况下都无法正常运行，任何具有生物学和编码专业知识的人都应该能够告诉我哪里出了问题。我正在尝试创建一个
我的代码还可以，只是它的工作对象是有选择性的。它为特定序列提供了正确的名称，但对于其他序列，它会弄乱。 例如，它会正确识别
我有以下数据框： 读名 <- c("tic", "tac", "toe") sequence <- c("TTTTTTTTATTTTTA","TTTTCTTTTTTTTT","GTTTTTTT") df &...
我打算使用shapeit5进行定相。我下载了1000G的参考数据集： https://mathgen.stats.ox.ac.uk/impute/1000GP_Phase3.html 但是，在运行 shapeit5 时出现此错误： 开幕
有人可以解释为什么我的代码返回不匹配，因为我认为你可以用“==”比较两个字典？ 导入 csv 导入系统 导入副本 def main(): # TODO：检查命令...
我有两个数据集，如下所示： biological_data（包含DNA上的位置列表，即不同长度范围的列表）： 类型 开始 结尾 宽度 A 171 884 714 A 20639 21148 ...
我无法再运行 Disambiguate(dna) 功能。我已经重新安装了 Decipher 包，但仍然无法正常工作。有人可以帮忙吗？ [关闭]
我曾经在 RStudio 2023.03.0 Build 386 上运行 Disambiguate(dna) 函数，但它不再起作用。此函数将 DNA 字符串（例如 R、Y、S 等）中任何不明确的碱基消歧为 ...
我试图在所有 DNA 链中找到最长的公共子串，但在测试中我使用的是数字串。 这是我写的函数： def lcsm（字符串列表）： strands = 排序（string_lis ...
我有一个包含约 10,000 个字符串的文件需要编辑。字符串很长（成百上千个字符），我想删除结尾附近的重复 A 或开头附近的 T...
我正在分析大量 DNA 序列，以识别那些包含由两个子模式组成的特定模式的序列，解释每个子模式的不同程度的不匹配。
如何检索用包'haplotypes'和'pegas'制作的单倍型的序列名称？
对于我当前的项目，我正在制作一些单倍型网络，使用“pegas”和“haplotypes”包。脚本运行流畅，给出了比较清晰的图形。但是，我想知道哪个
从具有 R 中许多物种序列的 fasta 中获取每个物种的共识序列
在 R 中，我有一个 fasta（例如：Andrenidae.FASTA），其中包含来自十几个物种的几百个核苷酸序列。我想为每个物种获得 1 个共识序列。每个序列由 A/C/T/G/N,...
我尝试插入AA。然后搜索 AA$ 以准确找到节点“AA”。但我收到的结果是“找不到序列”。我需要你的支持来帮助我找到那个问题的解决方案......
我必须做一个函数，打印出一段DNA的最长手印子串。我已经写了一个函数，用来检查一段DNA本身是否是一个词组。请看下面的函数。...