igraph 相关问题

igraph是一个免费的软件包,用于创建和操作大型无向和有向图。它是用C语言编写的,但是具有与R,Python或Ruby等高级语言的接口。

提取R中所有没有重复顶点属性的子图

我有一个像这样的图形对象: # 创建一个空图 GS <- make_empty_graph(n = 12, directed = FALSE) # Define vertex attributes vertex_attr(gss) <- list( name = c("1", &quo...

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如何使用 R 中的 igraph 包计算图形或网络中 2 星或楔形的数量

igraph 包提供了非常有效的计算图形或网络中三角形数量的方法,即 count_triangles() 函数。 我无法使用

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生成网络图以查看组之间的相似性

我有一些数据 CM(如下),其中包含 6 个基因组。图中的一些基因重叠。我创建了一个维恩图,但我的主管希望数据以不同的格式呈现。他们...

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绘制 igraph 对象时如何自定义最小和最大顶点大小并以选定的顶点大小创建图例

这是一个具有 10 个顶点的 igraph 对象,每个顶点都分配有两种颜色之一。我想绘制这个图,其顶点大小随变量 val 的变化而变化,该变量是长度为 10 的向量...

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在 R 中删除节点后添加回名称

我正在尝试基于此解决方案实现此代码: R函数从网络中逐一删除节点并输出最大的连通分量 图书馆(igraph) 克<- graph.data.fr...

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igraph Leiden 算法

我想知道igraph实现的Leiden算法是否存在已知问题。当我运行它时,与其他类似的算法相比,它会生成包含太多社区的分区...

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R - 使用点数据集(GPS 数据)进行网络分析

我是网络分析新手,但我正在为我正在进行的研究探索这个选项。 我想做的是检测点簇(来自 GPS 数据)。我知道有多种方法可以做到这一点,...

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R 如何使用边缘循环正确缩放修补的网络图表

使用网络图表时,某些节点可能有边缘循环,即它们连接到自身。当多个图表拼凑在一起且某些节点具有边缘循环时,

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提取网络主干后可以保留边权重吗?

我正在使用一个复杂的加权网络,我想使用 R 包“backbone”中的视差过滤器提取具有统计意义的主干网络。 (https://search.r-proje...

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igraph:有效计算多组顶点之间的边数

我想计算给定图的边计数矩阵,并将该图划分为组。我目前拥有的解决方案不适用于大图,我想知道它是否可能......

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为R中的数据帧对生成组id

我有六个数据框,其中一些包含相同的结构和值,但有些则不然。 我使用循环函数中的 equal() 比较了这些数据帧的所有组合并进行了总结

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根据应用于两条边的条件创建二分投影

我有一个具有不同源节点和目标节点的数据集,以及与关系相关的数字变量。 它看起来有点像这样: 图书馆(igraph) 图书馆(整理图) 设置.种子(2...

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在 igraph 收缩网络中处理顶点属性

此查询遵循另一个查询(igraph r 中的合约顶点保留所有节点属性?),有关折叠网络保留属性信息。我一直在尝试从...中提取文本

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如何识别连接更多连通子图的网络节点

我创建了一个网络图,如下所示。 我正在寻找一种方法来正式识别像我圈出的节点那样的节点。它将图表中两个连接更紧密的部分连接起来。 ...

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R中是否有R函数可以找到DAG在一定深度处的节点?

我是R中igraph包的新用户。我想提取一定深度的DAG节点列表。特定深度的节点没有公共边。有人可以帮忙吗...

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igraph:终端(非根)节点位于同一级别的树形图?

我想在 R 中使用 igraph 绘制一个树形图,使所有终端节点都处于同一级别,这与所有根节点都处于同一级别的默认情况不同。 layout_as_tree 有办法做到这一点...

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如何在igraph (R)中制作同心圆布局

我正在尝试创建一个特殊的图形布局,其中两种不同类型的节点(基于其属性)放置在具有不同半径的两个不同圆上(同心圆布局)。 这里是...

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绘制具有固定顶点位置和不重叠边的 igraph

我想用固定的顶点位置绘制我的 igraph 图,并在顶点周围自动绘制边缘,而不是在彼此之上,而不是在其他顶点下方并重叠...

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R 中的网络:快速且节省内存地提取非链接

我有一个相当稀疏的大型无向图(大约 150k 个节点),我想从该图中获取所有非链接的列表(因此是存在的链接集的补集)。到第一个

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python-igraph 文档不可用

看来我曾经访问过的类和函数的完整文档现在已被删除: https://igraph.org/python/doc/igraph.Graph-class.html https://igraph.org/python/doc/python-igrap...

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