素食主义者是与R一起用于分析生态群落，特别是植被群落的一揽子计划。它具有分析生态多样性和社区多变量分析的工具（NMDS，pCCA，pRDA等）
我有几个月内 4 个地点的物种数据。 我已经使用 R 中的 vegan 包成功创建了累积图，但我想将所有 4 个站点绘制在一张图上。 一开始我有一个...
我正在努力理解如何或是否可以使用 permanova （在 vegan::adonis2() 内）来分析具有 3 个级别的“治疗”但不同数量的 ne 级别的数据集。 .
我进行了 NMDS 分析并绘制了结果。然而，对于左边的图，我想获得一个图，其中我的各种处理的点被“总结”成一个 si...
我有一个包含 120 个调查点的数据集，每个调查点一年调查 4 次（总共 480 个调查）。我们每隔 3 分钟计算一次物种的存在或不存在......
permute 包中的函数 how() 可以在为 vegan::adonis2() 定义排列限制的上下文中支持不平衡数据吗？
我正在进行一项研究，比较三个不同森林地区的森林冠层间隙和封闭冠层森林中的昆虫群落。我的实验设计是分层且不平衡的。 简化版
biplot，或使用 ggplot2 绘制部分 RDA。使用 var_fit 计算的箭头不起作用？
我正在尝试绘制部分 RDA 和一些环境参数。 我按照这篇文章的想法使用 ggplot2 绘制 RDA。我还发现了另一篇文章，相反，所有...
如何按照 NMDS 向 ANOSIM 测试添加环境因素/解释变量
我正在尝试分析三个不同地点的物种组成与每个地点测量的环境因素之间的关系。我创建了一个 NMDS 图，然后开始...
当我尝试制作 CCA 图时，仅显示 25 个向量中的 4 个。 所以，我首先加载我的数据...... #加载包和数据 图书馆（素食） 物种 <- read.csv("D:/R/Code/TestSpiders.csv",...
我正在尝试加速重复稀疏数据帧以及随后添加生成的矩阵。一些背景信息：我要重复稀疏的数据集非常大（abo...
目标：使用数据框中当前的数据生成两个地点的稀疏曲线图，显示物种多样性如何随着采样样方数量的增加而增加。 问题：很多
我在 NMDS 图的数据周围添加省略号时遇到困难。我希望有两个单独的多边形椭圆颜色填充与站点点协调的颜色。 当我添加 stat_e...
我有一个研究设计，其中我在五个区块（B1-B5）中种植了三种不同的植物（S1 - S3），并进行了两种不同的处理（T1，T2）。我在两个时间点（Y1-...
我正在尝试在 R 中绘制 NMDS 分数的排序图，但我注意到有关 point_color 和 point_shape 与每个点不匹配的问题。例如站点 31 和 35 都是...
我有一个数据框，其中包含两次单独访问期间在某个地点检测到某种鸟类的次数（n=110）： 站点年份 总计.ACFL 总计.AMCR 总计.AMGO 总计.AMKE 总计.AMRE ...
我有一个数据框，其中包含两次单独访问期间在某个地点检测到某种鸟类的次数（n=110）： 站点年份 总计.ACFL 总计.AMCR 总计.AMGO 总计.AMKE 总计.AMRE ...
我正在尝试确定哪些行具有唯一性（仅在该行中观察到的物种，而不是在我的物种矩阵的任何其他行中观察到的物种）。我的数据矩阵设置为单独的列
我正在尝试确定哪些行具有唯一性（仅在该行中观察到的物种，而不是在我的物种矩阵的任何其他行中观察到的物种）。我的数据矩阵设置为独立的列
我目前正在进行一个项目，我需要知道从哪一天开始进行鸟类监测更方便/相关。为了做到这一点，我想用
我在使用 R 中的 vegan 包运行 NMDS 时遇到问题。我正在使用每单位努力捕获的鱼量 (CPUE)/丰度矩阵，我认为我的矩阵设置不正确。 这是合作...