vegan 相关问题

素食主义者是与R一起用于分析生态群落,特别是植被群落的一揽子计划。它具有分析生态多样性和社区多变量分析的工具(NMDS,pCCA,pRDA等)

当尺寸相同时,解决 "qr和y的行数必须相同 "的问题。

核心问题:对于"'qr'和'y'的行数必须相同 "可以做哪些调试 我正在运行一个RDA,之前已经做了几十次了。这次唯一不同的是我使用了......。

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R素包错误,说数据不能包含NA,但数据框架不包含NA。

我想用R素包中的metaMDS函数 对一些数据进行NMDS分析。我已经设法用类似的数据框架运行它,但由于某些原因,我得到了以下错误......

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在ggplot2中绘制envfit向量(素食包)。

我正在努力完成一个我在vegan和ggplot2中创建的NMDS图,但我想不出如何将envfit物种加载向量添加到图中。当我尝试添加时,它说 "无效的图形状态"。...

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decorana(df)中的错误:社区矩阵中所有行的总和必须是>0删除空站点。素食主义者的DCA

我试图在Vegan中运行PCA受到马蹄效应后的DCA,然而,我得到了以下错误代码。decorana(df)中的错误:所有行的总和必须是>0,在社区... ...

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将距离矩阵应用于多个数据帧

我有20个长度不同的数据帧,但是列数都相同。我想对每个数据帧进行一些分析,在这种情况下使用素食主义者进行距离矩阵分析。我有...

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创建一个将其他功能复制100次的功能

我正在尝试创建一个将其他两个函数复制100倍的函数,然后计算这些值的平均值。我有一个像这样的矩阵:str(pref)#num [1:9,1:158] 4 9 15 6 7 8 ...

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NMDS排序标准偏差椭圆和置信区间的清晰解释

我正在寻找一个清晰的解释,说明如何正确解释NMDS图上的排序椭圆,以及该解释如何随用户选择的不同置信度和椭圆'... >>>>

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确定应用metaMDS进行的自动转换

[当autotransform = TRUE时,如何确定metaMDS应用于社区数据的转换类型?

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将行名保留在纯素软件包中

我正在使用素食主义者软件包中的vegdist()来计算Morisita的相似性指数。我的数据的网站名称存储在第一列中。 TCR 3 0 0 0 MTF 0 1 2 0 UTZ 0 1 0 ...

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如何将向量添加到R中的NMDS上?

我正在尝试研究盐度是否对无脊椎动物群落结构有影响。我设法制作了NMDS,但是每次尝试ordiplot或envfit时,都会出现数据类型不正确的错误。 ...

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envfit结果如何创建?

我对如何从vegan包中的envfit()函数重新创建结果有疑问。这是envfit()与排序和环境向量一起使用的示例。 ...

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物种积累图的传说

如何向该图表添加标题?我尝试了以下命令,但我的图形消失了(纯素)数据(BCI)sp1

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如何为mvabund的R stat公式解释嵌套抽样设计?

我有一个实验数据集,其中4个水箱中有16条鱼(64条鱼)。有两种处理-加热和控制以及四个水箱。在水箱1和2中进行加热,而在水箱3中进行控制...

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有没有一种方法可以将第一列定义为R vegan软件包中用于标本的站点名称,以避免错误?

在这里苦苦挣扎的业余程序员。在我的数据集中,我的第一列是站点名称,称它们为Tech 1到Tech8。其余各列分别分配给一个物种,二进制值为0或1s ...

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R-在单轴折线图上操作尺寸

我正在使用Vegan包中的ordiplot函数为我的坐标数据绘制单轴图,代码如下:ordiplot(data,choices = 1)我只对第一个轴感兴趣,并且...

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