使用固定纵横比保存时的左对齐ggplot

Question

我正在构建自定义的ggplot主题，以标准化我生成的图形的外观。目标比这个最小的示例还要复杂，因此我正在寻找一个通用的解决方案。我有几个主要目标：

• 我希望所有图形都以相同的大小导出（宽3000像素，高1500像素）。
• 我想控制绘图面板本身的纵横比。
• 我想使用textGrobs来包含图形编号。
• 我希望图像左对齐

我面临的挑战是，当结合这两个约束时，保存的图像将在窗口内的ggplot图形居中，这在默认情况下是有意义的，但在这种情况下看起来很糟。

我希望有一个通用的解决方案，在导出时使ggplot面板左对齐。理想情况下，这对于多面图也将类似地工作。

似乎可以使用gridExtra，gtable，coopplot和egg包中的一种或某些组合来实现某些东西，但是经过几个小时的试验，我有点茫然。有人知道我该怎么做吗？我的代码包含在下面。

这是生成的图像。如您所见，标题在底部是左对齐的，但是ggplot本身是水平居中的。我也希望ggplot图左对齐。

图形输出：https://i.stack.imgur.com/5EM2c.png

library(ggplot2)

# Generate dummy data
x <- paste0("var", seq(1,10))
y <- LETTERS[1:10]
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(100, -2, 2)

# Generate heatmap with fixed aspect ratio
p1 <- ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile() +
    labs(title = 'A Heatmap Graph') +
    theme(aspect.ratio = 1)


# A text grob for the footer
figure_number_grob <- grid::textGrob('Figure 10',
                                     x = 0.004,
                                     hjust = 0,
                                     gp = grid::gpar(fontsize = 10,
                                                     col = '#01A184'))

plot_grid <- ggpubr::ggarrange(p1,
                               figure_number_grob,
                               ncol = 1,
                               nrow = 2,
                               heights = c(1,
                                           0.05))

# save it
png(filename = '~/test.png', width = 3000, height = 1500, res = 300, type = 'cairo')
print(plot_grid)
dev.off()

Answer 1

我能够找到满足我需要的解决方案，尽管确实有些棘手。

这是核心思想：

• 生成图无固定的宽高比。
• 将图例中的图例作为其自己的组成部分拆分
• 使用GridExtra的rangingGrob可以水平组合绘图，分隔符，图例和另一个分隔符
• 将图的宽度设置为npc的一部分（法向父坐标），在这种情况下为0.5。这意味着该图将占据输出文件水平空间的50％。
  • 请注意，这与为绘图设置固定的纵横比并不完全相同。如果您知道输出文件的大小，那么它是close，但是轴文本和轴标题的大小会影响面板本身的输出宽高比，因此，当您关闭面板时，并不是如果需要真正固定的宽高比，则为理想选择
• 将间隔物的宽度设置为npc的其余部分（在这种情况下，再次为0.5），减去图例的宽度，以使图例在剩余空间中水平居中。

这是我的代码：

library(ggplot2)

# Generate dummy data
x <- paste0("var", seq(1,10))
y <- LETTERS[1:10]
data <- expand.grid(X=x, Y=y)
data$Z <- runif(100, -2, 2)

# Generate heatmap WITHOUT fixed aspect ratio. I address this below
p1 <- ggplot(data, aes(X, Y, fill= Z)) + 
    geom_tile() +
    labs(title = 'A Heatmap Graph')

# Extract the legend from our plot
legend = gtable::gtable_filter(ggplotGrob(p1), "guide-box")


plot_output <- gridExtra::arrangeGrob(
    p1 + theme(legend.position="none"),                           # Remove legend from base plot
    grid::rectGrob(gp=grid::gpar(col=NA)),                        # Add a spacer
    legend,                                                       # Add the legend back
    grid::rectGrob(gp=grid::gpar(col=NA)),                        # Add a spacer
    nrow=1,                                                       # Format plots in 1 row
    widths=grid::unit.c(unit(0.5, "npc"),                         # Plot takes up half of width
                        (unit(0.5, "npc") - legend$width) * 0.5,  # Spacer width
                        legend$width,                             # Legend width
                        (unit(0.5, "npc") - legend$width) * 0.5)) # Spacer width

# A text grob for the footer
figure_number_grob <- grid::textGrob('Figure 10',
                                     x = 0.004,
                                     hjust = 0,
                                     gp = grid::gpar(fontsize = 10,
                                                     col = '#01A184'))

plot_grid <- ggpubr::ggarrange(plot_output,
                               figure_number_grob,
                               ncol = 1,
                               nrow = 2,
                               heights = c(1,
                                           0.05))

# save it
png(filename = '~/test.png', width = 3000, height = 1500, res = 300, type = 'cairo')
print(plot_grid)
dev.off()

这是输出图像：https://i.stack.imgur.com/rgzFy.png