validationMethod(as(object, superClass)) 中的错误：找不到对象“Matrix_validate”

Question

我只是尝试使用：

scRNA <- FindNeighbors(scRNA, dims = pc.num) 

和

scRNA.counts <- Read10X(data.dir = "filtered_feature_bc_matrix")    

他们都给出了这样的错误：

Error in validityMethod(as(object, superClass)) :    object 'Matrix_validate' not found

我猜这些代码在其他计算机上完全运行良好

所以我想知道我的代码有什么问题以及如何修复它？

Answer 1

确实，要为您解决问题，按照@Mikael Jagan 所说的操作就足够了：

update.packages("Matrix")

第二个想法：以上可能并不能完全解决问题： 由于还涉及其他软件包，其中一些可能必须重新安装（在Matrix

更新之后）。

您可以发布

的输出（或者如果太长的话可以对其进行很好的总结）

traceback() 出现您所看到的错误后立即？

Answer 2

尝试在函数调用之前执行此操作：

Matrix_validate = "CsparseMatrix_validate"