MetagenomeSeq 无法安装，错误提示它不适用于 Bioconductor 版本

Question

在几年没有使用 R 和所有软件包后，我正在尝试更新它。我的 MAC 运行的是 Sonoma 14.6.1。我需要安装 MetagenomeSeq 进行一些分析工作，但在安装时遇到了问题。

我已将 R 更新到版本 4.4.1，将 R studio 更新到版本 2024.09.0+375

我已经使用命令安装了 BioConductor 版本 3.20

install.packages("BiocManager")

我已验证 BiocManager 在 R Studio 的包选项卡中已打开

我可以使用命令安装其他软件包

BiocManager::install("name_of_package",force=TRUE)

但是当我尝试命令时

BiocManager::install("metagenomeSeq",force=TRUE)

我收到以下错误

警告信息：包“metagenomeSeq”不适用于 Bioconductor 版本“3.20”

适合您的 R 版本的此软件包的版本可能在其他地方可用，请参阅以下位置的想法 https://cran.r-project.org/doc/manuals/r-patched/R-admin.html#Installing-packages

我尝试直接在 R 而不是 R studio 中安装它，但出现了相同的错误。

表示它应该与 Bioconductor 3.20 一起运行

我还尝试了bioconductor.org/packages/release/bioc/html/metagenomeSeq.html页面上列出的代码

任何建议表示赞赏

Answer 1

在 Bioconductor 构建服务器上测试时，该包似乎出错了。正如另一位评论者所建议的，您可以尝试直接从 github 安装该软件包，但我会联系维护人员并查看他们是否仍然处于活动状态。或者，您可以下载 R 的早期版本和相关的 Bioconductor 版本，这应该仍然有效。