根据带有字母的另一列将值/字母分配给一列

Question

我想根据序列用 NAN（零值）分配/替换计数列，或用字母表替换列

熊猫数据框

IDS      sequence                substitute   count 
header1  GCTCAGCTGGCtAGAG          NAN           O
header1  >>>>........<<<<           <            4

预期产出

IDS      sequence                substitute   count 
header1  GCTCAGCTGGCtAGAG        NAN           Nan
header1  >>>>........<<<<          <            4

我尝试了下面链接中给出的代码，但没有运气

根据字符串条件为 pandas 数据框列赋值

我无法按预期改变，我明白了

    ids      sequence         Count count
0  header1  GCTCAGCTGGCtAGAG     0   NaN
1  header1  >>>>.........<<<     0   3

提前谢谢您

Answer 1

假设您想要将行与 DNA 序列（a/c/g/t 字母）匹配，您可以使用：

m = df['sequence'].str.contains('[acgt]', case=False)
df.loc[m, 'count'] = np.nan

输出：

       IDS          sequence substitute count
0  header1  GCTCAGCTGGCtAGAG        NAN   NaN
1  header1  >>>>........<<<<          <     4