用于GPU错误的LAMMPS - / usr / bin / ld：使用make命令时找不到-lmpi_stubs

Question

我正在尝试在gpu中安装LAMMPS。按照http://lammps.sandia.gov/doc/accelerate_gpu.html中给出的步骤后，我完成了步骤（a）并获得了文件 - libgpu.a和Makefile.lammps。

当我尝试继续第二步（make yes-make后制作序列号）时，我得到一个错误 - /usr/bin/ld: cannot find -lmpi_stubs。

Answer 1

该错误消息表明链接器无法找到构建所需的MPI库。通常，make serial在没有MPI支持的情况下构建lammps。来自make help（在lammps/src目录中调用）：

# serial = RedHat Linux box, g++4, no MPI, no FFTs

但是，Lammps GPU封装需要MPI。从而，

1. 确保安装了必要的MPI库。
2. 使用以下命令之一构建lammps（有关更多选项，请参阅make help）： make g++（编译：g ++ 4，MPI实现：MPICH2） make g++3（编译：g ++ 3，MPI实现：MPICH2） make linux（编译：icc，MPI实现：MPICH2） make openmpi（编译：mpic ++，MPI实现：OpenMPI-1.1）