R 中的不等数据帧比较 - ifelse 命令

Question

我有两个数据集，看起来像这样：

1. biological_data（包含DNA上的位置列表，也就是不同长度范围的列表）：

类型	开始	结束	宽度
A	171	884	714
A	20639	21148	510
乙	1287309	1287818	510

昏暗（生物数据） 126 4

2. consensus_seq（包含已知序列的列表，每个序列的长度为 9）：

ID	顺序	开始	结束
1	TTTTCACA	209	218
2	TTTTGCACA	500	508
3	TTTTACACA	5233	5242
4	TTTTCACA	1287900	1287909

昏暗（共识序列） 8394 4

我想验证 biological_data 中的位置是否包含 consensus_seq 文件中的序列。因此，理想情况下，我想获得一个修改过的 biological_data 表，该表将包含一个新列，其中包含该位置包含的共识序列列表。

理想结果方案：

类型	开始	结束	宽度	共识ID
A	171	884	714	1 2
A	20639	21148	510	NA
乙	1287309	1287818	510	4

我不是生物信息学家，甚至我也不是天天用R或Python，所以对我来说很有挑战

所以，我找到了比较这些位置的开始和结束的最佳方法。 如果短共有序列的开始和结束包含在来自 biological_data 的序列范围内，则打印此共有序列 ID。

我试过：

ifelse (biological_data$start <= 171  &  biological_data$end >= 884, consensus_seq$ID, NA)

然后我从 biological_data 中得到一个位置列表，其中包含 consensus_sequence 1 ...但是，对每 8394 个序列手动执行它是不可能的，或者需要很多时间。

当我尝试过时：

ifelse (biological_data$start <= consensus_seq$Start  &  biological_data$end >= consensus_seq$end, consensus_seq$ID, NA)

• 没成功：

警告信息： 1：在 biological_data$start <= consensus_seq$Start : longer object length is not a multiple of shorter object length 2: In biological_data$end >= consensus_seq$end 中： 较长的物体长度不是较短物体长度的倍数

如何自动化“ifelse process”？如何将第二个数据集（consensus_seq）的每个位置与第一个数据（biological_data）的每个位置进行比较？在 R 中有可能吗？