使用Python将netCDF文件转换为csv

Question

我正在尝试将 netCDF 文件转换为 csv。文件存储在 thredds 服务器中。我编写了下面的代码来读取文件 Thredds 服务器并从 netCDF 文件中存在的变量列表中选择六个变量，并将它们以 csv 格式存储在本地。

from datetime import datetime
from netCDF4 import Dataset
import netCDF4
import pandas as pd
import csv
def get_thredds_url(datetime_group, forecast_hour):
    base_url="path"
    thredds_url="path"
    cycle_hour = "%02d" % datetime_group.hour
    file_str=datetime_group.strftime("%Y%m%d%H")+"/gfs.t%sz.pgrb2.0p25.f%03d" % \
        (cycle_hour, forecast_hour)
    url = base_url + thredds_url + file_str
    return (url)

下面的代码显示了所需的变量。

def main():

    datetime_group = datetime(2017, 9, 26, 0)
    forecast_hour = 240

    url = get_thredds_url(datetime_group, forecast_hour)
    print (url)

    nc_handle=Dataset(url)
    #print (nc_handle.variables.keys())
    lat=nc_handle.variables['lat'][:]
    lon=nc_handle.variables['lon'][:]
    issue_time=nc_handle.variables['time'][:]
    valid_time=nc_handle.variables['time1'][:]
    temp=nc_handle.variables['Temperature_height_above_ground'][:]
    dewpoint_temp=lat=nc_handle.variables['Dewpoint_temperature_height_above_ground'][:]
    dtime = netCDF4.num2date(issue_time[:],units=units)


 tmp = pd.Series(temp, index=dtime) 

    tmp.to_csv('temp.csv',index=True, header=True)
    csvwriter = csv.writer(tmp,  delimiter=',')
    print (csvwriter)





if __name__ == "__main__":
    main()

问题：我无法将文件写入 csvnformat，其中包含所有变量，例如 lat、lon、time、time1、Temperature_height_above_ground。所需的输出如下：

tmp.csv

 lat lon time time1 Temperature_height_above_ground
1 ... .. ...  ....  ......
2 ... .. ...  ....  ......
3 ... .. ...  ....  ......

有人可以帮我解决这个问题吗？

提前致谢！

Answer 1

我想你正在寻找的是这个：

with open('temp.csv', 'w') as f:
  writer = csv.writer(f, delimiter=',')
  # write the header
  writer.writerow(['lat',
                   'lon',
                   'time',
                   'time1',
                   'temp_height_above_ground',
                   'dewpoint_temp_height_above_ground',
                   'issue_time'])

  # collect the columns as rows
  rows = zip(lat,lon,issue_time,valid_time,temp,dewpoint_temp,dtime)

  for row in rows:
    writer.writerow(row)

Answer 2

您可以使用 Python 中的这个简单代码逐步将 NETCDF 转换为 CSV。我们需要 2 个主库

a-NetCDF-4 :-
（网络通用数据表，版本 4） 描述。 NetCDF 是一组软件库和自描述、独立于机器的数据格式，用于面向数组的科学数据*

b-xarray：xarray（以前称为 xray）是一个开源项目和 Python 包，它使标记多维数组的使用变得简单、高效且有趣！

导入库：

   import netCDF4 as nc
   import xarray as xr

   data = nc.Dataset(r'C:\\Users\\Admin\\Desktop\\LDN DATA NC FORMAT\\20210312_0257.nc', 'r')
   dataset = xr.open_dataset(xr.backends.NetCDF4DataStore(data))
   df = dataset.to_dataframe()
   csv_data=df.to_csv('C:\\Users\\Admin\\Desktop\\LDN DATA NC FORMAT\\20210312_0257.nc.csv')
   print('\nCSV String:\n', csv_data)

屏幕截图#1：

屏幕截图#2：

执行完成后，将 csv 文件保存在提供的同一文件夹中