如何禁用 Pybel 中记录的警告？

Question

我正在使用 Pybel - OpenBabel API 的 Python 包装器，并且我正在尝试禁用诸如此类的警告：

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*** Open Babel Warning  in ParseComplex
  Illegal aromatic element b-

当从 ChEMBL 获取指纹分子 SMILES

时，我的警告不断发出

Answer 1

您可以从

OBMessageHandler

模块获取 openbabel 记录器（

openbabel

类）的句柄。诀窍是首先从 pybel 模块访问 openbabel 模块，获取

OBMessageHandler

类，并实例化记录器 (docs)：

import pybel

ob_log_handler = pybel.ob.OBMessageHandler()

使用手柄，您可以将

log_level

设置为 0 以禁用 除关键消息之外的所有消息 (docs):

ob_log_handler.SetOutputLevel(0)

您可以使用以下枚举（此处的文档）来选择日志记录级别。默认值为 1，记录所有 警告:

• 0：严重
• 1：警告（默认）
• 2：信息
• 3：审核（当分子被破坏/感知时）
• 4：调试

Answer 2

Aelfinn 的答案对我不起作用，但以这种方式访问 SetOutputLevel 却可以：

pybel.ob.obErrorLog.SetOutputLevel(0)

Answer 3

如果您想摆脱所有错误消息：

pybel.ob.obErrorLog.StopLogging()

Answer 4

我们可以在没有 pybel 的情况下配置 openbabel 的记录器，如下所示：

from openbabel import openbabel
openbabel.obErrorLog.StopLogging()