有一种方法在R中使用PMAX和PMIN函数使用字符串变量名称的向量使用Tidyverse(dplyr)格式?
例如, 我想运行以下内容:
data(mtcars)
mtcars %>% mutate(maxval = pmax(drat, wt, na.rm = T)
正确地让我得到以下内容:
mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb maxval
Mazda RX4 21.0 6 160.0 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 3.900
Mazda RX4 Wag 21.0 6 160.0 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 3.900
Datsun 710 22.8 4 108.0 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 3.850
Hornet 4 Drive 21.4 6 258.0 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 3.215
Hornet Sportabout 18.7 8 360.0 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 3.440
Valiant 18.1 6 225.0 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1 3.460
Duster 360 14.3 8 360.0 245 3.21 3.570 15.84 0 0 3 4 3.570
Merc 240D 24.4 4 146.7 62 3.69 3.190 20.00 1 0 4 2 3.690
Merc 230 22.8 4 140.8 95 3.92 3.150 22.90 1 0 4 2 3.920
Merc 280 19.2 6 167.6 123 3.92 3.440 18.30 1 0 4 4 3.920
Merc 280C 17.8 6 167.6 123 3.92 3.440 18.90 1 0 4 4 3.920
Merc 450SE 16.4 8 275.8 180 3.07 4.070 17.40 0 0 3 3 4.070
Merc 450SL 17.3 8 275.8 180 3.07 3.730 17.60 0 0 3 3 3.730
Merc 450SLC 15.2 8 275.8 180 3.07 3.780 18.00 0 0 3 3 3.780
Cadillac Fleetwood 10.4 8 472.0 205 2.93 5.250 17.98 0 0 3 4 5.250
Lincoln Continental 10.4 8 460.0 215 3.00 5.424 17.82 0 0 3 4 5.424
Chrysler Imperial 14.7 8 440.0 230 3.23 5.345 17.42 0 0 3 4 5.345
Fiat 128 32.4 4 78.7 66 4.08 2.200 19.47 1 1 4 1 4.080
但要说我正在处理具有很多变量的非常大的数据,我只想使用像x1 = sprintf("xval_%1.0f", 1:25)
values = c("drat", "wt")
mtcars %>% mutate(maxval = pmax(all_of(values), na.rm = T))
pmin与。但是当我这样做时,我总是会收到一条错误消息,使向量数与观察数的数量混淆。例如,说我运行以下内容:Error: Problem with `mutate()` column `maxval`.
i `maxval = pmax(values, na.rm = T)`.
i `maxval` must be size 32 or 1, not 2.
然后我得到以下错误:
invoke
似乎正在观察的数量(32)。
我们可以使用
do.call
(类似于base R
)
across
输出
library(purrr)
library(dplyr)
out <- mtcars %>%
mutate(maxval = invoke(pmax, c(across(all_of(values)), na.rm = TRUE)))
# or use do.call
# mutate(maxval = do.call(pmax, c(across(all_of(values)), na.rm = TRUE)))
或也可以使用
> head(out)
mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb maxval
Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 3.900
Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 3.900
Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 3.850
Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 3.215
Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 3.440
Valiant 18.1 6 225 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1 3.460
exec
输出
out2 <- mtcars %>%
mutate(maxval = exec(pmax, !!! rlang::syms(values), na.rm = TRUE))
现在,dplyr包括与> head(out2)
mpg cyl disp hp drat wt qsec vs am gear carb maxval
Mazda RX4 21.0 6 160 110 3.90 2.620 16.46 0 1 4 4 3.900
Mazda RX4 Wag 21.0 6 160 110 3.90 2.875 17.02 0 1 4 4 3.900
Datsun 710 22.8 4 108 93 3.85 2.320 18.61 1 1 4 1 3.850
Hornet 4 Drive 21.4 6 258 110 3.08 3.215 19.44 1 0 3 1 3.215
Hornet Sportabout 18.7 8 360 175 3.15 3.440 17.02 0 0 3 2 3.440
Valiant 18.1 6 225 105 2.76 3.460 20.22 1 0 3 1 3.460
c_across
函数,以启用精选助手,例如starts_with
,
ends_with
和
all_of
where(is.numeric)
library(dplyr)
values = c("drat", "wt")
out <- mtcars %>%
rowwise() %>%
mutate(maxval = max(c_across(all_of(values)), na.rm=TRUE))
+rowwise()
通常超级慢。您可以将pmap()
结合使用,以便更快地选择仍然友好的选择:
across()
尽管@akrun的基于
library(tidyverse)
mtcars %>%
mutate(maxval = pmap(across(one_of(c("drat", "wt"))), ~max(c(...))))
/
invoke()
的方法可能仍然慢。