问题是,当我运行npsavetext时,它不能正常工作,我最初将其作为while循环(在我看来,这是最理想的选择,它循环遍历具有匹配列表的列表并将它们附加到单个列表中。文件)
下面是我的代码:
atable=['a','b','b','a','b','b']
f=open(tempfilename,'ab')
f.write(b"\n")
with open(tempfilename,'ab') as f:
for s in atable:
structuredArr=np.array([s,"+"])
np.savetxt("./fastqs/"+tempfilename, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])
f.close()
预期结果如下:
a
+
b
+
b
+
a
+
b
+
b
实际结果是
+
b
理想情况下,我实际上想做的是下方:
icounter=0
f=open(tempfilename,'ab'
while icounter < len(tempid):
with open(tempfilename,'ab') as f:
# Creating the type of a structure
structuredArr=np.array([tempid[icounter],tempseq[icounter],"+",tempqc[icounter]])
np.savetxt("./fastqs/"+tempfilename, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])
f.write("\n")
icounter=icounter+1
f.close()
我虽然后者可能由于我的while循环而没有追加。
任何帮助都会很棒。
[使用with open
时,使用缩进的块进行保存。
In [329]: atable=['a','b','b','a','b','b']
...: with open('abtest.csv','ab') as f:
...: for s in atable:
...: structuredArr=np.array([s,"+"])
...: np.savetxt(f, structuredArr, delimiter=' ', fmt=['%s'])
...:
In [330]: cat abtest.csv
a
+
b
+
b
+
a
+
b
+
b
+